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Enregistrement W4313349587 · doi:10.4049/jimmunol.190.supp.196.3

NADPH oxidase 2 activity modulates antigen processing and epitope repertoires (P5186)

2013· article· en· W4313349587 sur OpenAlexaff
Jason C.M. Lemmon, Dale R. Balce, Joanna M. Rybicka, Robin M. Yates

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeAntigen processingNADPH oxidaseAntigenPhagosomeImmune systemCell biologyBiologyAntigen presentationChemistryImmunologyIntracellularT cellReactive oxygen species

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Phagocytes such as macrophages and dendritic cells are essential to both the innate and acquired immune systems of mammals. To produce effective immune responses, material antigens must first be processed and presented by phagocytes. The importance of antigen processing is often overlooked, which is exemplified by current therapies focusing on downstream immune processes in T cells and B cells. However, these therapies often result in modulation of the immune system as a whole. Instead, it would be ideal to modulate antigen processing to prevent the generation of epitopes able to stimulate and re-stimulate specific T cells. Antigen processing within phagosomes is a dynamic process influenced by several environmental factors such as pH and oxidative burst. Of particular importance to our lab is the oxidative burst generated by the protein complex NADPH oxidase 2. Our lab has previously published data showing that regulation of NADPH oxidase 2 activity results in modulation of phagosomal proteolysis through modulation of cysteine cathepsin activity. We further hypothesize that protein antigen processing and epitope repertoire generation can be predicted and more importantly influenced by changing the activity of NADPH oxidase 2. Using a combination of fluorometric data, HPLC, and mass spectrometry we have begun to show, through preliminary data, that epitope repertoires can indeed be influenced without knocking down antigen processing and presentation as a whole.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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