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Enregistrement W4313351493 · doi:10.4049/jimmunol.190.supp.141.15

Elucidating the role of bovine heavy- and light-chain variable domains in polyspecific antigen-binding (P6104)

2013· article· en· W4313351493 sur OpenAlexaffabout
Yfke Pasman, Azad Kaushik

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunoglobulin light chainAntigenEpitopeBiologyGeneAntibodyAntibody RepertoireGermlineGeneticsMolecular biologyImmunoglobulin heavy chainHeavy chain

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The bovine antibody repertoire is generated from a limited germline sequence divergence as well as combinatorial diversity. Generation of an exceptionally long CDR3H (up to 61 amino acids) in the heavy chain variable region (VH) provides an additional mechanism to generate antibody diversity, not found in other species to date. These long CDR3H loops, present in polyspecific IgM, originate from VDJ recombination encoded by a specific VH gene, unusually long single DH-gene (capable of encoding up to 51 codons) and insertion of 15-18 base long conserved short nucleotide sequences (CSNS) specifically at VH-DH junction. In cattle, it is thought that antigen-binding is mainly a function of the variable-region of the heavy chain where light chain provides only structural support. To test this hypothesis, single chain variable fragment (scFv) and single domains (Fd) from polyspecific IgM were constructed. Both purified scFv as well as FdVH showed polyspecific binding to structurally dissimilar antigens in an ELISA. Whether scFv and FdVH bind to multiple epitopes on an antigen or if they recognize the same epitope can now be determined. The structural-functional complexities of these antibody fragments and the role of the heavy- and light-chains in antigen-binding will be discussed. [Supported by NSERC Canada]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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