Elucidating the role of bovine heavy- and light-chain variable domains in polyspecific antigen-binding (P6104)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The bovine antibody repertoire is generated from a limited germline sequence divergence as well as combinatorial diversity. Generation of an exceptionally long CDR3H (up to 61 amino acids) in the heavy chain variable region (VH) provides an additional mechanism to generate antibody diversity, not found in other species to date. These long CDR3H loops, present in polyspecific IgM, originate from VDJ recombination encoded by a specific VH gene, unusually long single DH-gene (capable of encoding up to 51 codons) and insertion of 15-18 base long conserved short nucleotide sequences (CSNS) specifically at VH-DH junction. In cattle, it is thought that antigen-binding is mainly a function of the variable-region of the heavy chain where light chain provides only structural support. To test this hypothesis, single chain variable fragment (scFv) and single domains (Fd) from polyspecific IgM were constructed. Both purified scFv as well as FdVH showed polyspecific binding to structurally dissimilar antigens in an ELISA. Whether scFv and FdVH bind to multiple epitopes on an antigen or if they recognize the same epitope can now be determined. The structural-functional complexities of these antibody fragments and the role of the heavy- and light-chains in antigen-binding will be discussed. [Supported by NSERC Canada]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».