High avidity and functionality of virus-specific CD8 T cells associated with protection during HCV reinfection (VIR2P.1168)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The majority of acute hepatitis C virus (HCV) infection (75%) leads to chronicity and liver diseases. While 25% of infected individuals can naturally clear the infection, long-term protection is elusive and reinfection can occur. We have previously showed that protection from viral persistence upon HCV reinfection correlates with expansion of HCV specific T cells with increased breadth. Viral persistence was associated with limited expansion of virus specific T cells. CD8 T cell receptor (TCR) repertoire analysis showed that clonotypes associated with protection upon reinfection are recruited from the memory population, with focusing of the repertoire. We hypothesized that protective immune memory response is associated with selection of T cell clonotypes with the highest TCR avidity and a polyfunctional profile. We FACS sorted HCV-specific CD8 T cells to generate individual clones representative of clonotypes of high, medium or low frequency in the TCR repertoire. Tetramer titration assay showed that the TCR avidity correlated with the clonotype expansion in vivo upon reinfection. All clones showed a polyfunctional profile but the main function varied between clones. In conclusion, our results suggest that the main determinant for the expansion of memory HCV specific CD8+ T cells during HCV reinfection was the TCR avidity. The results of this study have implications for the development of vaccination regimens to boost generation and selection of such clonotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».