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Enregistrement W4313356833 · doi:10.4049/jimmunol.194.supp.52.11

An intricate link between autophagy and microRNAs in cystic fibrosis (HUM1P.262)

2015· article· en· W4313356833 sur OpenAlexaff
Mia Tazi, Duaa Dakhlallah, Hany Khalil, Kyle Caution, Clay B. Marsh

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagymicroRNADownregulation and upregulationATG16L1Cell biologyBiologyCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorGeneGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Each year 1,000 children and adults are diagnosed with Cystic Fibrosis (CF), a fatal genetic disorder that critically affects the lungs. Autophagy, a highly-regulated biological process, normally functions to clear dysfunctional CFTR (CF transmembrane conductance regulator) proteins that aggregate within macrophages. However, this process is defective in CF patients and CF mice, as their macrophages express limited autophagy activity thus exacerbating inflammation. Present therapies to improve autophagy are ineffective. MicroRNAs (miRNAs, miRs) are non-coding RNAs that post-transcriptionally regulate targeted mRNA expression. The objective for this study is to elucidate the role of miRNAs in CF macrophages in an effort to restore autophagy. We hypothesize CF macrophages exhibit elevated cluster expression that downregulate autophagy targets thus contributing to autophagy dysfunction. We find that, CF macrophages exhibit decreased autophagy protein expression and elevated cluster expression compared to WT. When cluster expression is absent, autophagy protein expression is restored, suggesting the canonical inverse relationship between miRNA and protein expression. Predicted autophagy targets of specific miRs comprising the cluster were validated. In vivo downregulation of specific miRs comprising the cluster increases autophagy expression. Thus, this data demonstrates, microRNA cluster expression correlates to autophagy expression which modulates the pathophysiology of CF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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