MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313359446 · doi:10.4049/jimmunol.200.supp.56.27

Profiling the effects of carbonic anhydrase 9/12 inhibition on tumor associated macrophage/microglia polarization in glioma

2018· article· en· W4313359446 sur OpenAlexaff
Nathaniel Boyd, Braden C. McFarland, Paul C. McDonald, Shoukat Dedhar, Anita B. Hjelmeland

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGliomaMicrogliaTemozolomideCancer researchBrain tumorHypoxia (environmental)TranscriptomeBiologyTumor hypoxiaTumor microenvironmentIn vivoPhenotypeRadiation therapyGene expressionImmunologyPathologyMedicineChemistryGeneInternal medicineTumor cellsInflammationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Brain tumor microenvironments, including hypoxia and acidic stress, contain a subset of stem-like neoplastic cells termed brain tumor initiating cells (BTICs) that are resistant to chemo- and radiotherapy, providing a reservoir for tumor recurrence and a desirable target for glioma treatments. In prior studies, we have shown that inhibition of carbonic anhydrases 9 and 12 (CA9/12) in combination with chemotherapeutic temozolomide effectively delayed in vivo growth in a BTIC xenograft model. CA9/12 are hypoxia-responsive genes shown to be elevated in tumors that modulate the intra- and extracellular pH in tumor microenvironments. Importantly, downstream effects of hypoxia have shown CSF-1R induction, which can polarize tumor associated macrophages/microglia (TAM) toward an immunosuppressive phenotype and further exacerbate tumor progression. We have profiled CA9/12 inhibitor-treated GBM tumors using integrative omics (kinomics/transcriptomics) and discovered a shift in kinomic activity and gene expression that suggests an immunosuppressive transition in TAMs. Validating this observation, we characterized surface expression of CD11b+ TAMs post-treatment and discovered decreased expression of MHCII (inflammatory) and increased expression of CD206 (immunosuppressive). Together, our data suggest that by understanding the immunophenotypic shift that happens in response to CA9/12 inhibition in glioma, we may be able design a treatment strategy to improve upon the effectiveness of inhibitor therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetHistone Deacetylase Inhibitors ResearchTravaux en français237 207