The transcription factor ROR alpha preserves group 3 innate lymphoid cell lineage identity and function
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Innate lymphoid cells (ILCs) are critical for host defense and tissue repair. The transcription factor RORα is essential for ILC2 development but it is also highly expressed by ILC3s where its function remains poorly defined. Previously, we found that Rorasg/sg bone marrow transplant (BMT) mice were protected from intestinal fibrosis in a Salmonella--induced model of Crohn’s disease and that this is due to defective cytokine production by ILC3s. In the current study, whole transcriptome sequencing analysis reveals a striking downregulation of ILC3 signature genes in RORα-deficient ILC3s isolated from Salmonella infected mice. In particular, the expression of genes involved in sensing an inflammatory milieu is attenuated. Moreover, we find that Rorasg/sg ILC3s fail to express IL-17A following ex vivo stimulation with IL-23 and IL-1β. Consistent with these observations, we also find that Rorasg/sg BMT mice are more susceptible to Citrobacter rodentium infection due to attenuated expression of IL-22 and impaired induction of antimicrobial peptides. Collectively, our data suggests that RORα plays a key role in preserving functional ILC3s by modulating their ability to sense environmental cues that stimulate the efficient production of cytokines. These observations also suggest that targeting ILC3 cells could be of therapeutic benefit in fibrosis associated with Crohn’s disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».