Identification of extracellular vesicle proteins in circulating exosomes from human lung transplant recipients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular mechanisms involved in rejection following human lung transplantation (LTx) are not well understood. We identified proteomic signatures of clinical outcomes in circulating extracellular vesicles (EVs) isolated from human lung transplant recipients (LTxRs) who was diagnosed with chronic rejection (Bronchiolitis Obliterans Syndrome (BOS)), acute rejection (AR), respiratory viral infection requiring intervention (RVI) or stable following transplantation. Differential analysis revealed one protein unique to AR (Skin-specific protein 32), four unique to RVI (Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2, Transmembrane 9 superfamily member 2, Ras-related C3 botulinum toxin substrate 2, and EH domain-containing protein) and two unique to stable (Coagulation factor X, and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase). Comparison of each rejection group to stable identified 128, 180, and 216 significantly differentially expressed proteins (p-value<0.05, fold-change>2) in BOS, AR, and RVI respectively. Although no unique signatures were found in BOS, an increased enrichment of immune processes such as antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I and Fc receptor signaling pathway were observed. Functional enrichment analysis (Gene Ontology) associated differentially expressed EV proteins in AR and RVI conditions with wound repair processes. These diverse signatures detected in each condition highlight complex immune mechanisms underlying the pathophysiology of rejection following LTx. Future studies are needed to validate these signatures in larger LTxR cohorts in order to promote early clinical diagnosis and predict outcome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».