Epithelial expression of IL-17 mediates a gut-associated inflammatory response in the purple sea urchin larva.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Immune response to microbial disturbance in the gut involves coordinated activity of gut epithelial cells, motile immune cells and other cells throughout the organism. Many of these functions are ancient among bilaterians, although it is not yet clear how they relate among animal phyla. As morphologically simple organisms that share an important genetic heritage with vertebrates, sea urchin larvae offer a novel, experimentally tractable system in which to characterize the gut-associated immune response. We have developed a model to characterize gene regulatory control of this response using the marine bacterium Vibrio diazotrophicus. When exposed to Vibrio in the surrounding seawater, bacteria accumulate in the gut and later invade the body cavity. Bacteria that enter the blastocoel are rapidly cleared by a coordinated response of phagocytic and granular immune cells. Peripheral immune cells migrate through the body cavity and accumulate at the gut. RNA-Seq data indicate that the most acutely upregulated gene in the early phase of response are two types of IL17 genes. Whole mount in situ hybridization and BAC-based fluorescent protein reporters indicate that these genes are expressed within gut epithelial cells. Notably, perturbation of IL17 receptor signaling results in reduced levels of tnfaip3 (a negative feedback inhibitor of IL17), nfkbiz (an IL17 target gene in vertebrates), the transcription factors cebpα and cebpγ and soul1 (SOUL domains are evolutionarily widespread and involved in immune responses). These results indicate that the highly regulated IL17 expression in the gut epithelium and signaling through IL17R1 form a central axis of larval gut-associated immunity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».