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Enregistrement W4313360029 · doi:10.4049/jimmunol.198.supp.226.24

Epithelial expression of IL-17 mediates a gut-associated inflammatory response in the purple sea urchin larva.

2017· article· en· W4313360029 sur OpenAlexaff
Katherine M. Buckley, Jonathan P. Rast

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePediatric health and respiratory diseases
Établissements canadiensCentre for Social InnovationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyImmune systemSea urchinCell biologyMicrobiologyIntestinal epitheliumInnate immune systemImmunologyEpitheliumGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Immune response to microbial disturbance in the gut involves coordinated activity of gut epithelial cells, motile immune cells and other cells throughout the organism. Many of these functions are ancient among bilaterians, although it is not yet clear how they relate among animal phyla. As morphologically simple organisms that share an important genetic heritage with vertebrates, sea urchin larvae offer a novel, experimentally tractable system in which to characterize the gut-associated immune response. We have developed a model to characterize gene regulatory control of this response using the marine bacterium Vibrio diazotrophicus. When exposed to Vibrio in the surrounding seawater, bacteria accumulate in the gut and later invade the body cavity. Bacteria that enter the blastocoel are rapidly cleared by a coordinated response of phagocytic and granular immune cells. Peripheral immune cells migrate through the body cavity and accumulate at the gut. RNA-Seq data indicate that the most acutely upregulated gene in the early phase of response are two types of IL17 genes. Whole mount in situ hybridization and BAC-based fluorescent protein reporters indicate that these genes are expressed within gut epithelial cells. Notably, perturbation of IL17 receptor signaling results in reduced levels of tnfaip3 (a negative feedback inhibitor of IL17), nfkbiz (an IL17 target gene in vertebrates), the transcription factors cebpα and cebpγ and soul1 (SOUL domains are evolutionarily widespread and involved in immune responses). These results indicate that the highly regulated IL17 expression in the gut epithelium and signaling through IL17R1 form a central axis of larval gut-associated immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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