<i>IGHV</i> and <i>IGHD</i> encoding antibodies with exceptionally long CDR3H are predominant in the bovine neonatal B cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We sequentially analyzed 18 RNA-seq libraries from three newborn calves as compared to their dams to understand the development of neonatal humoral immunity. A significant shift in neonatal transcriptome occurs within first week of life post-birth. A set of 110 differentially expressed immune-related genes is noted at birth that include complement, MHCII, chemokine receptors, defensins and cytokines etc. As compared to adults, IGKC is expressed at higher levels in the neonates, despite predominant IGLC expression at birth. The IGHM and IGHD transcripts are expressed at birth and IGHM achieves adult levels by day 7. This is followed by IGHA and IGHG transcripts 14–28 days post birth. Interestingly, most 3′ IGHV1S1(BF4E9) gene, known to encode antibodies with exceptionally long CDR3H, is preferentially expressed in neonatal B cells. In parallel, single longest IGHD2(DH2) gene that encodes such an atypical CDR3H is expressed at high levels at birth. It seems that IGHV1S1(BF4E9) gene has an important functional role in the development and expansion of bovine neonatal B-cell repertoire. To conclude, the bovine neonate acquires humoral immunocompetence by four weeks of neonatal life. [Supported by NSERC Canada Discovery Grant]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».