The hematopoietic transcription factor GATA2 is a novel regulator of apoptotic cell clearance by macrophages in atherosclerosis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Atherosclerosis is an inflammatory disease involving formation of lipid-rich lesions within the arteries. Macrophages clear apoptotic cells that accumulate within these lesions. Defective apoptotic cell clearance is a hallmark of advanced atherosclerotic disease, yet mechanisms that drive this defect are poorly understood. In this study, we identify the hematopoietic transcription factor GATA2 as a novel regulator of macrophage-mediated apoptotic cell clearance. Macrophages were isolated by laser capture microdissection from atherosclerotic lesions in aortic tissue obtained from patients undergoing open heart surgery. Gene expression profiling was performed on these macrophages by microarray, with macrophages derived from peripheral blood monocytes used as a control. We found approximately 3,000 genes to be differentially expressed in aortic punch macrophages, with enrichment in pathways involved in apoptotic cell clearance. In particular, we identified upregulation of GATA2. Mutations in GATA2 have previously been associated with increased risk of coronary artery disease and we found that overexpression of GATA2 in vitro resulted in decreased ability of macrophages to both internalize and degrade apoptotic cells. Conversely, GATA2 downregulation is sufficient to abrogate oxLDL-induced defective apoptotic cell clearance. Atherosclerotic macrophages exhibit dysregulated expression of genes involved in apoptotic cell clearance and upregulation of GATA2. Recapitulation of GATA2 overexpression is sufficient to impair apoptotic cell clearance in vitro. To our knowledge, we are the first to identify a potential role for GATA2 in driving defective apoptotic cell clearance in atherosclerosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».