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Enregistrement W4313368595 · doi:10.4049/jimmunol.204.supp.146.3

The hematopoietic transcription factor GATA2 is a novel regulator of apoptotic cell clearance by macrophages in atherosclerosis

2020· article· en· W4313368595 sur OpenAlexaff
Charles Yin, Angela M. Vrieze, James Akingbasote, Emily N. Pawlak, Rajesh Abraham Jacob, Jonathan Hu, Neha Sharma, Garth Blackler, Jimmy D. Dikeakos, Lillian Barra, Dave Nagpal, Bryan Heit

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownregulation and upregulationGATA2HaematopoiesisApoptosisBiologyCell biologyCellCancer researchTranscription factorMicroarray analysis techniquesMacrophageImmunologyGene expressionIn vitroGeneStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Atherosclerosis is an inflammatory disease involving formation of lipid-rich lesions within the arteries. Macrophages clear apoptotic cells that accumulate within these lesions. Defective apoptotic cell clearance is a hallmark of advanced atherosclerotic disease, yet mechanisms that drive this defect are poorly understood. In this study, we identify the hematopoietic transcription factor GATA2 as a novel regulator of macrophage-mediated apoptotic cell clearance. Macrophages were isolated by laser capture microdissection from atherosclerotic lesions in aortic tissue obtained from patients undergoing open heart surgery. Gene expression profiling was performed on these macrophages by microarray, with macrophages derived from peripheral blood monocytes used as a control. We found approximately 3,000 genes to be differentially expressed in aortic punch macrophages, with enrichment in pathways involved in apoptotic cell clearance. In particular, we identified upregulation of GATA2. Mutations in GATA2 have previously been associated with increased risk of coronary artery disease and we found that overexpression of GATA2 in vitro resulted in decreased ability of macrophages to both internalize and degrade apoptotic cells. Conversely, GATA2 downregulation is sufficient to abrogate oxLDL-induced defective apoptotic cell clearance. Atherosclerotic macrophages exhibit dysregulated expression of genes involved in apoptotic cell clearance and upregulation of GATA2. Recapitulation of GATA2 overexpression is sufficient to impair apoptotic cell clearance in vitro. To our knowledge, we are the first to identify a potential role for GATA2 in driving defective apoptotic cell clearance in atherosclerosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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