Mucosal correlates associated with natural regression of HPV-associated dysplasia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Anal HPV infection and associated pre-cancerous changes, known as anal intraepithelial neoplasia (AIN), are common among men who have sex with men (MSM). While natural regression of AIN is often observed, there are currently no predictors for disease outcomes. Therefore, we assessed mucosal immune and microbiological correlates of natural AIN regression. Methods Fifty-five HIV-infected, ART-treated MSM were recruited, of whom 26 had confirmed AIN. The microbiome was defined via qPCR and 16s sequencing of anal swabs; biopsies were collected from both healthy and AIN-confirmed sites by high-resolution anoscopy, and lymphocyte populations were defined by flow cytometric analysis including CD38 and HLA-DR as activation markers. AIN regressors vs non-regressors were compared by Mann-Whitney (SPSS). Results AIN regression was observed in 15/26 (58%) participants. Regression was associated with a higher proportion of CD8+ T cells (p= 0.006), and AIN regressors had significantly higher levels of both activated CD8+ (p= 0.023; 44.5% vs 27.9%) and activated CD4+ T cells (p=0.023; 20.4% vs 9.81%) compared to non-regressors. Interestingly, AIN regressors had reduced microbiome diversity (p=0.026; 241 vs 284 OTUs) and a trend towards a lower bacterial load (p=0.059). While age was similar between groups, AIN regressors had been living with HIV for a shorter time (p=0.023). No differences were observed between groups in T cells derived from AIN-free anal mucosa. Conclusions AIN-specific immune activation was associated with subsequent regression of AIN. Given that AIN non-regressors had greater anal microbiome diversity, defining key bacterial species and their role in HPV pathogenesis may merit further investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».