Characterization of new circular RNA products from the <i>Pax-5</i> gene in B-cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Circular RNAs (circRNAs) represent a new class of RNAs which are highly expressed and conserved in mammalian cells. CircRNAs regulate many biological processes and their aberrant expression is often associated with disease progression. We have identified and characterized circRNAs generated from the Pax-5 gene, an essential transcription factor for B-cell lineage commitment and also, a potent oncogene. Given the pivotal role of Pax-5 gene products in B-cell development and function, we set out to profile Pax-5 circular RNA (circPax5) expression and elucidate their role in B-cell biology. We identify and map five major circPax5 transcript isoforms which are found in B-cell lines and primary B-cells isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of healthy donors. These circPax5 variants consists of circular single-stranded RNA sequences corresponding to: i) exons 2–3; ii) exons 2–4; iii) exons 2–5; iv) exons 2–6; and, v) exons 2–8 of the human Pax-5 gene. Using TaqMan assays designed to target each unique circPax5 junction region, we found that circPax5 expression profiles vary with B-cell developmental stages. Furthermore, circPax5 exons 2–5 and 2–6 are overexpressed in patients suffering from chronic lymphocytic leukemia (CLL). Functionally, we observe that circPax5 products modulate B-cell processes and interact by sponging of specific micro-RNAs. Altogether, we identify new genetic products (i.e. circRNAs) generated from a prominent immune-regulating gene (Pax-5). The functional elucidation of circPax5 products will potentially bring insight into the function and signaling of B-cell processes and disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».