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Enregistrement W4313379914 · doi:10.1016/j.meegid.2022.105400

Emerging tick-borne spotted fever group rickettsioses in the Balkans

2022· article· en· W4313379914 sur OpenAlexaff
Pavle Banović, Adrian Alberto Díaz-Sánchez, Angélique Foucault‐Simonin, Lourdes Mateos‐Hernández, Alejandra Wu‐Chuang, Clémence Galon, Verica Simin, Dragana Mijatović, Ivana Bogdan, Belkis Corona, Liani Coronado, Joanna Kulisz, Aneta Woźniak, Zbigniew Zając, Dasiel Obregón, Sara Moutailler, Alejandro Cabezas‐Cruz

Notice bibliographique

RevueInfection Genetics and Evolution · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésSpotted feverRickettsiaTickBiologyTyphusTick-borne diseaseRickettsia rickettsiiVirologyRickettsia conoriiZoonosisVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The impact of tick-borne pathogens (TBPs) on human health has increased in the last decades, since the incidence of emerging and re-emerging infectious and zoonotic tick-borne diseases has increased worldwide. Tick-borne rickettsiae of the Spotted Fever group (SFGR) are considered as emerging pathogens that can infect humans and cause a variety of non-specific clinical symptoms. Here, we report nine cases of atypical tick-borne diseases (9/460; 1.95%) that occurred over a period of four months (from 15 April 2021 to 16 August 2021) in Serbia, from which five cases were classified as confirmed SFGR infection, two cases as probable SFGR infection and two cases as suspected SFGR infection. Within cases of confirmed SFGR infection, R. helvetica was detected as the causative agent in two cases. The most common clinical finding was non-expanding persistent circular redness, followed by eschar and enlargement of regional lymph nodes, and pain at lesion site. Rickettsia outer membrane protein B (ompB) and citrate synthase (gltA) gene fragments were amplified from clinical samples and ticks attached to patients and IgG reacting with Rickettsia conorii antigen were detected in sera samples of patients, which are highly suggestive of exposure to SFGR. Surveillance and monitoring of rickettsial diseases in Serbia should continue and extended to new areas due to the increasing trend of clinical infections caused by SFGR in the country.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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