DNA Methylation impairs monocyte function in tuberculosis leading to disease progression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Despite treatment and cure, Tuberculosis (TB) is still considered a world health public problem. It is known that interaction between bacteria and host immune mechanisms results in changes in gene expression, which could be a result of epigenetic changes, as DNA methylation. Recent studies suggest that alterations in host epigenome could be promoted by Mtb infection and influence immune cells function. In this context, we aimed to determine the methylation profile of monocytes from tuberculosis patients and correlate with immune function of these cells. Monocytes were isolated from active TB patients (APTB) with treatment-time less than one month (n=10) and non-disease controls (CTRL) (n=16) - Ethics Committee approval FMRP-USP (Protocol #6481/2013). The monocytes were used to evaluate the global DNA methylation content and immune function, through cytokine and ROS production after heat killed Mtb challenge. When we evaluated the group of tuberculosis patients according to their lung injury degree, we found an increased methylation in those with more severe disease. Also, it was possible to observe that monocytes from patients with increased methylation profile, presented a reduction in secretion of anti-inflammatory cytokine, IL-10 and increased pro-inflammatory IL-12, indicating impairment in monocytes ability to regulate the excess of inflammation, which mediates the lung injury often observed in these patients. Hence, we suggested that global DNA methylation content might act as a clinic prognostic toll for active tuberculosis disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».