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Enregistrement W4313382040 · doi:10.4049/jimmunol.198.supp.147.16

Utilizing previously identified <i>in vitro</i> correlates of protection to predict the efficacy of a novel vaccine candidate against the intracellular bacterium <i>Francisella tularensis</i>

2017· article· en· W4313382040 sur OpenAlexaff
Roberto De Pascalis, Helen M Brook, Blake Frey, Wayne Conlan, Anders Sjöstedt, Karen L. Elkins

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacillus and Francisella bacterial research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCLPBFrancisella tularensisFrancisellaBiologyMicrobiologyTularemiaImmune systemVirologyAttenuated vaccineVaccinationIntracellular parasiteVirulenceImmunologyHeat shock proteinGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Francisella tularensis (Ft) is an intracellular bacterium that causes tularemia, a disease with a low incidence in US. The only available vaccine, the Live Vaccine Strain (LVS), is investigational and is derived from Type B Ft, not the more virulent Type A Ft. Previous work produced potential correlates to predict successful vaccination. These were determined by in vitro stimulation of murine Ft LVS-immune cells and analyses of their gene expression. We used this approach to investigate correlates of protection for the novel ΔclpB vaccine, derived from Type A Ft SchuS4. Mice were vaccinated with ΔclpB as well as LVS-derived vaccines and subsequently challenged with a lethal dose of LVS, after which all mice vaccinated with ΔclpB and LVS survived. The in vivo survival data was compared with in vitro data obtained from PBLs and splenocytes from vaccinated mice. In general, the in vitro functions of leukocytes from ΔclpB-vaccinated mice were comparable or exceeded those of leukocytes from LVS-vaccinated mice, including control of LVS intramacrophage replication, IFN-gamma secretion, and NO production. Correlates up-regulated in cells from mice vaccinated with ΔclpB included IFN-gamma, IL-21, Nos2, LTA, T-bet, IL-12rbeta2, CCL5 and GzmB; in some cases up-regulation was higher than that from LVS-derived PBLs. Other genes were up-regulated in ΔclpB-derived but not LVS-derived leukocytes, suggesting that improved protection stimulated by the ΔclpB vaccine may be related to the change in strain and/or to stronger immune responses. Hence, this panel of correlates could contribute to the screening of new vaccine candidates, bridging from animal models to humans, and augmenting clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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