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Enregistrement W4313382735 · doi:10.4049/jimmunol.204.supp.148.33

NATURAL KILLER CELL KILLING OF EXTRACELLULAR PSEUDOMONAS AERUGINOSA

2020· article· en· W4313382735 sur OpenAlexaff
David Feehan, Khusraw Jamil, Christopher H. Mody

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiopolymer Synthesis and Applications
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGranzymePerforinGranulysinCytotoxic T cellBiologyMicrobiologyGranzyme BCytolysisImmune systemImmunologyT cellCD8Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that commonly infects individuals with the genetic illness, Cystic Fibrosis and contributes to airway blockage and loss of lung function. NK cells are cytotoxic, granular lymphocytes that are part of the innate immune system. NK cell secretory granules contain the cytolytic proteins granulysin, perforin and granzymes. NK cells, in addition to their cytotoxic effects on cancer and virally infected cells have been shown to play a role in an innate defense against microbes. Hypothesis NK cells will kill P. aeruginosa using cytolytic effector protein(perforin, granulysin or granzymes) alone or working synergistically. Results Live-cell imaging of a co-culture of YT cells, a human NK cell line, incubated with GFP P. aeruginosa in the presence of the viability dye, propidium iodide, demonstrated that YT cell killing of P. aeruginosa is contact-mediated. CRISPR knockout of granulysin or perforin in YT cells had no significant affect on NK cell killing of P. aeruginosa, as determined by CFU counts. Pre-treatment of YT and NK cells with the serine protease inhibitor 3,4-Dichloroisocoumarin (DCI) to inhibit granzymes, resulted in an inhibition of killing. CRISPR knockout of granzyme B in YT cells, in addition to treatment with the granzyme A inhibitor Futhan, significantly inhibited killing of P. aeruginosa, as determined by CFU counts. These results suggest that NK cells induce membrane damage in P. aeruginosa through a contact dependent process, and that killing requires granzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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