MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4313385069 · doi:10.4049/jimmunol.198.supp.52.6

A Subset of Human Autoreactive CD1c-Restricted T Cells Preferentially Express TRBV4-1+ TCRs and Recognize Phospholipids

2017· article· en· W4313385069 sur OpenAlexaff
Tingxi Guo, Edward M.Y. Koo, Naoto Hirano

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensCentre for Social InnovationPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCD1CD80CD154T cellCell biologyCD40Antigen-presenting cellMHC class IICytotoxic T cellImmune systemImmunologyBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Unlike the highly polymorphic, peptide-presenting conventional MHC molecules, CD1 consists of a family of monomorphic, lipid-presenting proteins. Recent studies have revealed the molecular basis of mycobacterial lipid recognition by CD1a-c-restricted T cells. In addition to foreign lipids, subsets of CD1a-c-restricted T cells recognize self-lipids, which may have implications for human diseases such as autoimmunity and cancer. And yet, the molecular identity of these self-reactive T cells remains largely elusive. In this study, using a novel CD1c+ artificial antigen-presenting cell (aAPC)-based system, we have isolated human CD1c-restricted autoreactive T cells and characterized them at the molecular level. By employing the human cell line K562, deficient in MHC class I/II and CD1 expression, as a backbone, we generated an aAPC expressing CD1c as the sole antigen-presenting molecule with costimulatory molecules, CD80 and CD83. When stimulated with this CD1c+ aAPC endogenously presenting self-lipids, a subpopulation of primary human CD4+ T cells from multiple donors consistently upregulated CD154 (CD40L) in a CD1c-specific manner. These activated CD4+ T cells preferentially expressed TRBV4-1+ TCRs. Interestingly, TRAV usage and CDR3 sequences of these TRBV4-1+ T cells were diverse. Clonotypic analyses of the reconstituted TRBV4-1+ TCRs demonstrated that the heterogeneity of the CDR3 sequences greatly impacted the strength of CD1c-restricted autoreactivity. Furthermore, cell-free assays using recombinant CD1c loaded with distinct lipids identified several phospholipid species as potential self-ligands. These data provide new insights into the molecular identity of human autoreactive CD1c-restricted T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Immunology→Même sujetImmune Cell Function and Interaction→Travaux en français237 207→