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Enregistrement W4313385570 · doi:10.4049/jimmunol.196.supp.204.33

miRNAs are critical for the regulation of RAG expression and secondary Ig rearrangement in peripheral B lymphocytes

2016· article· en· W4313385570 sur OpenAlexaff
Sergei B. Koralov, Maryaline Coffre, David Benhamou, Lili M. Blumenberg, David Riess, Valentina Snetkova, Marcus Hines, Tirtha Chakraborty, Kari B. Jensen, Ka Chun Chong, Robert Blelloch, Dan R. Littman, Doron Melamed, Jane A. Skok, Klaus Rajewsky

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDicerBiologyDroshaRecombination-activating genemicroRNAB cellCell biologyDownregulation and upregulationMolecular biologyGeneGeneticsRNA interferenceRNAAntibodyRecombination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The differential expression of miRNAs throughout B cell development suggests that these ncRNAs contribute to stage-specific regulation of the intricate transcriptional program during B cell development. Conditional ablation of Dicer or deletion of the miR-17~92 cluster in early pro-B cells, revealed a critical role of miRNAs in B cell differentiation. In the present study we compare the phenotypes of mice in which enzymes critical for miRNA biogenesis, Dicer, Drosha and DGCR8 are conditionally ablated in B lymphocytes, allowing us to definitively explore the role of miRNAs in B cell development and function. Global ablation of miRNAs in B lymphocytes lead to an early block in B cell development. Rescue of B cell surviva by overexpression of the anti-apopotic factor Bcl2 revealed that in the absence of miRNAs, B cells in the periphery expressed low levels of Ig heavy chain without expressing light chain. We demonstrate that miRNA-deficient B cells fail to regulate recombination machinery in the periphery, resulting in ongoing Ig light chain gene rearrangement. In addition to the upregulation of RAG1/2 in peripheral B cells, we demonstrated ongoing DNA double strand breaks at Ig light chain loci and upregulation of surrogate light chain components. We show that these events occur downstream of deregulated PI3K signaling and we recapitulate many of these defects in wild-type B lymphocytes by targeting individual components of PI3K signaling network. Furthermore, we achieve complete rescue of miRNA deficient B cells when we introduce a pro-survival Bcl2 transgene along with an Ig transgene resistant to light chain editing. Our data highlight an important and novel role for miRNAs in the maintenance of a mature phenotype in peripheral B cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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