MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313385899 · doi:10.4049/jimmunol.194.supp.145.16

Identification of MHC bound peptides from murine bone marrow derived dendritic cells infected with <i>Salmonella</i> (VAC9P.1108)

2015· article· en· W4313385899 sur OpenAlexaff
Karuna P. Karunakaran, Yu Hong, Xiaozhou Jiang, Queenie W. T. Chan, Michael F. Goldberg, Leonard J. Foster, Marc K. Jenkins, Robert Brunham

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis Viruses Studies and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalmonellaBiologySalmonella entericaAntigenImmune systemMHC class IMicrobiologyAntimicrobial peptidesMajor histocompatibility complexImmunityImmunologyVirologyAntimicrobialBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Salmonella infections cause a spectrum of diseases ranging from self-limiting diarrhea to life-threatening systemic disease. Diseases caused by Salmonella are treatable with antibiotics but successful antibiotic treatment has become increasingly difficult due to antimicrobial resistance. An effective vaccine is therefore the best strategy to reduce these diseases. A clear understanding of host immunity to Salmonella is essential to aid in the development of a vaccine. Protective immunity against Salmonella depends on a wide range of innate and adaptive immune mechanisms and T cell-mediated immune responses are important in the host control of intracellular Salmonella infection. Our laboratory used an immunoproteomics approach to identify Chlamydia T cell antigens that exhibited significant protection against Chlamydia infection in mice when used as vaccines. These results demonstrate that T cell antigens identified by immunoproteomics can be successfully exploited as T cell vaccines against an intracellular pathogen. Recently we generated dendritic cells from bone marrow of C57BL/6 mice and infected with Salmonella entericaSL1344 followed by elution of MHC class I and class II-bound peptides. The sequences of the purified peptides were then identified using tandem mass spectrometry. We identified 87 MHC class II and 23 MHC class I Salmonella derived peptides. These antigens are of use in Salmonella immunobiology research and as potential Salmonella vaccine candidates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetHepatitis Viruses Studies and EpidemiologyTravaux en français237 207