Chronic upper airway inflammation is characterized by an extrafollicular B cell response and elevated antibody production in humans (HUM1P.260)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Chronic rhinosinusitis (CRS) is an upper airway disease that affects 30 million Americans and a subgroup of CRS patients also has nasal polyps (CRSwNP). In CRSwNP patients, inflamed sinus tissues can be removed as part of treatment, which provides a unique model system to investigate mechanisms of human mucosal inflammation. We have previously reported local elevations in NP of B cells, antibodies (Ab), and expression of Epstein-Barr virus-Induced protein 2 (EBI2), a marker of extrafollicular plasma cells (PC). To characterize the mechanisms mediating these responses, we assessed B cells from fresh tissue (d0) or after 4 days of culture (d4) from NP, uncinate tissue (UT) or tonsils from CRS and control subjects by flow cytometry. We measured Ab production by multiplex array and assessed formation of B cell follicles by immunohistochemistry. We assessed the Ab repertoire by DNA deep sequencing and by analysis of Ab genes from single cells. We found that NP uniquely supported the accumulation of PC (p<0.01) and Ab production (p<0.05) in vitro. Plasmablasts (PB) and PC were Ki67+, and EBI2 expression was highest on PB. We found no evidence for increased B cell follicles in NP compared to control UT (n>10/group). Ab from NP had fewer CDR3 mutations than Ab from UT (p<0.05), but more mutations than Ab from peripheral blood (p<0.05). These data suggest that there is a strong extrafollicular B cell response in NP that may drive Ab production during chronic airway inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».