TCF-1 controls Treg functions that regulate inflammation, CD8 T-cell cytotoxicity, and severity of colon cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The transcription factor TCF-1 is essential for the development and function of T regulatory (Treg) cells, however its function is poorly understood. Here, we show that TCF-1 primarily suppresses transcription of genes that are co-bound by Foxp3. Single-cell RNA-seq analysis identified effector- and central-memory Treg-cells with differential expression of Klf2 and memory and activation markers. TCF-1 deficiency did not change the core Treg transcriptional signature, but promoted alternative signaling pathways whereby Treg-cells became activated and gained gut-homing and TH17 characteristics. TCF-1-deficient Treg-cells strongly suppressed T-cell proliferation and cytotoxicity, but were compromised in controlling CD4+ T-cell polarization and inflammation. In mice with polyposis, Treg cell-specific TCF-1 deficiency promoted tumor growth. Consistently, tumor-infiltrating Treg cells of colorectal cancer patients showed lower TCF-1 expression and increased TH17 expression signatures compared to adjacent normal tissue and circulating T-cells. Thus, Treg cell-specific TCF-1 expression differentially regulates TH17-mediated inflammation and T-cell cytotoxicity, and can determine colorectal cancer outcome. Supported by NIH R01 AI 108682 (FG & KK), NIH RO1 AI 147652 (FG), NIH R35GM138283 (MK), and Praespero Innovation Award Alberta, Canada (FG & KK)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».