Investigating immune tolerance: characterization of immunoregulatory DN T cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Autoimmunity results from defects in immune tolerance pathways that impair the capacity of immune cells to distinguish between self and non-self. One of these immune tolerance processes involves immunoregulatory TCRαβ+ CD4− CD8− double negative T cells (DN T). Indeed, DN T cells protect from autoimmune pathologies and graft rejection in mice. Similarly, high DN T cell numbers correlate with a low incidence of chronic graft-versus-host disease in humans, an autoimmune-like pathology. While the thymic differentiation process of DN T cells was recently described, the function of these unconventional T cells is still poorly documented. To characterize DN T cells, we performed bulk RNA sequencing on CD4, CD8, γδ and DN T cells isolated from mouse spleen. Comparison of the transcriptome profiles revealed that DN T cells express a unique signature. Moreover, following in vitro stimulation, we find that DN T cells also present a distinct cytokine secretion pattern. Interestingly, we observed a lower induction of CD69, LAG-3 and PD-1 on DN T cells in comparison to CD4 and CD8 T cells, whereas LCK phosphorylation is unabated. DN T cell proliferation in mixed lymphocyte reactions is also lower than that of CD4 and CD8 T cells. Overall, our transcriptomic and cytokine analyses clearly identify DN T cells as a unique T cell subset. Moreover, while DN T cells do not express an exhaustion profile, they are more refractory to in vitro T cell stimulation than conventional T cells. A better characterization of DN T cell function will help conceive novel immunotherapies to treat autoimmune diseases. Supported by the Canadian Institutes of Health Research - PJT 159603. S.P. was supported by a postdoctoral CIHR fellowship
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».