Upregulated Ly-6 gene expression is associated with poor overall survival in uterine corpus endometrial carcinoma patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The human Ly-6 (hLy-6) gene family has recently gained interest for its possible role in tumor progression. High expression of hLy-6 genes is associated with poor overall survival in pancreatic ductal adenocarcinoma patients. To expand upon this work, we have carried out in silico analyses of all known hLy-6 gene expression in other cancers using TNMplot which shows differential gene expression in cancer tissues. We have also analyzed the patient survival by Kaplan-Meier plotter after mining the TCGA database. We report that upregulated expression of several hLy-6 genes is associated with poor cancer patient survival in many other cancer types, especially uterine corpus endometrial carcinoma (UCEC). Importantly, the expression of a number of hLy-6 genes is elevated in UCEC tissue when compared to the expression in normal uterine tissue. Further analysis of tumor-specific expression of the hLy-6 gene family is needed to uncover the function of Ly-6 proteins as well as the signaling pathways these proteins trigger that endow tumor survival and poor patient prognosis. Human Ly-6 gene products can potentially be used as biomarkers for cancer detection and as tumor associated antigens to identify high-risk cancer patients and appropriately design and/or calibrate cancer treatments for such patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».