The mutation <i>PTPN6</i>Ala455Thr causing pulmonary emphysema affects B lymphocyte populations and causes spontaneous pulmonary tertiary lymphoid tissue formation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background A new mutation responsible for causing severe and early pulmonary emphysema was recently discovered in a French-Canadian family. The mutation is located in the PTPN6 gene (PTPN6Ala455Thr) leading to a reduction in the activity of SHP-1, a phosphatase that regulates numerous pathways including B cell differentiation and activation. Here, we aimed to characterize B cell abnormalities in both humans and mice carrying this mutation. Methods Circulating B cell populations in humans carrying the PTPN6Ala455Thr mutation were analyzed by flow cytometry and immunoglobulin levels were measured in serum. In mice carrying the same mutation (Ptpn6Ala457Thr) aged up to 12 months, B cell populations were analyzed by flow cytometry and lung tissue histology performed. Mice were immunized with the T cell-independent antigen NP-Ficoll and plasma was collected to assess NP-specific antibodies. Results Human carriers of the PTPN6Ala455Thr mutation had reduced IgG1 and IgG4, and increased IgG3 levels as well as high circulating immature/mature B cell ratio compared to controls. Aging Ptpn6Ala457Thr mice developed spontaneous pulmonary tertiary lymphoid tissues and exhibited higher B-1 cells and lower B-2 cells proportions in the lung and spleen. Ptpn6Ala457Thr mice had lower levels of NP-specific IgG1 antibodies compared to the wild-type group, but normal IgG3 in response to NP-Ficoll immunization. Conclusion SHP-1 appears to be important to B cell development and functions, as the PTPN6Ala455Thr mutation seems to cause a form of subclinical immunodeficiency that affects B cell populations and immunoglobulin levels. The link between B cell abnormalities and development of pulmonary emphysema requires further investigation. Supported by grants from Canadian Institutes of Health and Research and Fonds de Recherche du Québec- Santé
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».