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Enregistrement W4313431764 · doi:10.4049/jimmunol.208.supp.66.09

Proteomic analysis of plasma exosomes as biomarkers of response to MVP-S based immunotherapy

2022· article· en· W4313431764 sur OpenAlexaff
Pascal Y. Smith, Evelyn Teh, Ken Chisholm, Susanne Penny, Devanand M. Pinto, Kelcey Patterson, Brennan S. Dirk, Moamen Bydoun, Stephan Fiset, Yogesh Bramhecha, Heather A. Hirsch, Оlga Hrytsenko, Jeremy R. Graff

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrovesiclesImmune systemExosomeImmunotherapyBiomarkerCancer researchProteomeOvarian cancerImmunologyBiologyMedicineCancerInternal medicineBioinformaticsmicroRNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ovarian cancer is a deadly gynaecological disease owing to its late-stage diagnosis. Recurrence and chemo-resistance develop despite initial treatment success. Maveropepimut-S (MVP-S), formerly DPX-Survivac, is a DPX-based immune educating therapy that elicits robust, targeted and, sustained specific anti-tumor T- and B-cell responses in advanced ovarian cancer patients. Exosomes are a subtype of extracellular vesicles (EVs) secreted by cells involved in intercellular communication. They contain bioactive molecules that can influence the tumor, the immune system, and the extracellular environment. Hence, circulating exosomes could provide real time assessment of disease evolution making them ideal minimally invasive biomarkers for monitoring response to immunotherapies. Plasma exosomes were isolated from advanced ovarian cancer patients (n=22) at pre- and on-treatment with MVP-S based therapy (DeCidE1 trial, NCT02785250). Subjects with clinical benefit (>10% tumor shrinkage) to therapy displayed a lower overall total EV protein concentration. Untargeted proteomic profiling by liquid chromatography tandem mass spectrometry identified 227 proteins in exosomes. Of these, 95 (42%) were likely from non-tumor exosomes and involved in immune modulation such as regulation of humoral response and B-cell immunity. When compared to the plasma proteome, 128 (56%) proteins were found to be exclusive to exosomes. Functional annotations of these proteins suggest their role in modulating immune pathways related to Fc receptor mediated signaling and T-cell migration. The results highlight the potential value of plasma exosome assays for monitoring disease and as a potential surrogate response biomarker. Supported by -IMV inc. -NRC-IRAP R&D Certificate Program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
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