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Enregistrement W4313431794 · doi:10.4049/jimmunol.208.supp.108.04

Proteogenomic immune signatures delineate the landscape of pediatric acquired demyelinating syndromes

2022· article· en· W4313431794 sur OpenAlexaff
Diego A. Espinoza, Ina Mexhitaj, Jacqueline Smiler, Fernanda Mafra, Renata Pellegrino da Silva, Giulia Fadda, Eric Yeh, Ruth Ann Marrie, Douglas L. Arnold, Rui Li, Brenda Banwell, Amit Bar‐Or

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of ManitobaUniversity of TorontoSickKids FoundationMontreal Neurological Institute and HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineImmune systemImmunologyMultiple sclerosisMyelin oligodendrocyte glycoproteinExperimental autoimmune encephalomyelitis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Approximately 20–30% of children presenting with acquired inflammatory demyelinating syndromes (ADS) have multiple sclerosis (MS). Another 30% harbor serum antibodies against myelin oligodendrocyte glycoprotein and are referred to as having MOG-associated disease (MOGAD). While MS and MOGAD can have similar features, differences in response to immune therapies point to distinct underlying immune mechanisms. To assess potentially distinct immune mechanisms underlying MS and MOGAD, we applied proteogenomics to high quality cryopreserved peripheral blood mononuclear cells collected from patients with ADS prior to institution of immune therapy, as well as from healthy controls. CITE-Seq profiling was applied to a total of 92,716 single cells with equal contribution from 24 children (6 healthy donors; 6 with ADS but neither MS or MOGAD; 6 with MOGAD; and 6 with MS, ascertained with long-term follow-up). Analysis revealed a pan-ADS enrichment of atypical (CD11c+) B cells compared to healthy controls. Children with MS were distinguished from children with MOGAD by MS-specific enrichments of checkpoint-molecule (TIGIT and CD137)-expressing CD8 memory T cells, STAT4+ Th1 CD4 memory T cells and CD56dim/CD16+ NK cells. Overall, our study identifies distinct features of circulating cellular immune profiles that may serve to distinguish children with MS and MOGAD, and provides novel insights into early immune mechanisms that may be involved in each of these conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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