MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313484939 · doi:10.1371/journal.pdig.0000159

Interpretable machine learning for automated left ventricular scar quantification in hypertrophic cardiomyopathy patients

2023· article· en· W4313484939 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuePLOS Digital Health · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensVector InstituteToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institute for Advanced ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyCardiologyInternal medicineMedicineArtificial intelligenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Scar quantification on cardiovascular magnetic resonance (CMR) late gadolinium enhancement (LGE) images is important in risk stratifying patients with hypertrophic cardiomyopathy (HCM) due to the importance of scar burden in predicting clinical outcomes. We aimed to develop a machine learning (ML) model that contours left ventricular (LV) endo- and epicardial borders and quantifies CMR LGE images from HCM patients.We retrospectively studied 2557 unprocessed images from 307 HCM patients followed at the University Health Network (Canada) and Tufts Medical Center (USA). LGE images were manually segmented by two experts using two different software packages. Using 6SD LGE intensity cutoff as the gold standard, a 2-dimensional convolutional neural network (CNN) was trained on 80% and tested on the remaining 20% of the data. Model performance was evaluated using the Dice Similarity Coefficient (DSC), Bland-Altman, and Pearson's correlation. The 6SD model DSC scores were good to excellent at 0.91 ± 0.04, 0.83 ± 0.03, and 0.64 ± 0.09 for the LV endocardium, epicardium, and scar segmentation, respectively. The bias and limits of agreement for the percentage of LGE to LV mass were low (-0.53 ± 2.71%), and correlation high (r = 0.92). This fully automated interpretable ML algorithm allows rapid and accurate scar quantification from CMR LGE images. This program does not require manual image pre-processing, and was trained with multiple experts and software, increasing its generalizability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,638

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle