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Enregistrement W4313487152 · doi:10.21203/rs.3.rs-2437256/v1

Efficient production of isobutanol from glycerol in Klebsiella pneumoniae: Regulation of acetohydroxyacid synthase, a rate-limiting enzyme in isobutanol biosynthesis at gene expression level

2023· preprint· en· W4313487152 sur OpenAlexaff
Min-Ho Jo, Sun-Yeon Heo, Jung‐Hyun Ju, Ki Jun Jeong, Min‐Soo Kim, Chul‐Ho Kim, Baek-Rock Oh

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesKorea Research Institute of Bioscience and BiotechnologyKorea Institute for Advancement of TechnologyMinistry of Trade, Industry and Energy
Mots-clésIsobutanolGlycerolBiochemistryBiosynthesisEnzymeMetabolic engineeringKlebsiella pneumoniaeChemistryBiologyGeneEscherichia coliAlcohol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Glycerol is inexpensive and abundant, and can be used for the industrial production of value-added products. Isobutanol is an important industrial chemical that has many applications, and its biosynthesis from different carbon sources has been studied using various microorganisms. So far, isobutanol production by Klebsiella pneumoniae has been mainly studied using glucose. In this study, we produced isobutanol from glycerol based on the K. pneumoniae ΔldhAΔadcmutant harboring pBR-iBO used in previous study using K. pneumoniae, which has an excellent ability to assimilate glycerol even under limited conditions. Results: We investigated the effect of different acetohydroxyacid synthase (AHAS) isoenzymes (rate-limiting enzymes in isobutanol biosynthesis), plasmid copy number, and different promoters as a method to increase isobutanol production by K. pneumoniae. The K. pneumoniae Cu ΔldhAΔbudA, pUC-tac-BN-ISO strain produced 2.56-fold more isobutanol than previously reported for glycerol-derived isobutanol production. Also, the in vitro enzyme activity of AHAS I (ilvBN) was greater than that of the other two isoenzymes (ilvIHand ilvGM). Evaluation of process factors indicated that an agitation speed of 200 rpm with the culture maintained at pH 6 were favorable conditions for isobutanol production (1.02 g/L). Conclusion: We obtained enhanced isobutanol production from glycerol by metabolic engineering of K. pneumoniae. Our results demonstrated enhanced production of isobutanol from glycerol, and suggest future avenues for research in this area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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