Classification of <scp> <i>GBA1</i> </scp> Variants in Parkinson's Disease: The <scp> <i>GBA1</i> ‐PD </scp> Browser
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: GBA1 variants are among the most common genetic risk factors for Parkinson's disease (PD). GBA1 variants can be classified into three categories based on their role in Gaucher's disease (GD) or PD: severe, mild, and risk variant (for PD). OBJECTIVE: This review aims to generate and share a comprehensive database for GBA1 variants reported in PD to support future research and clinical trials. METHODS: We performed a literature search for all GBA1 variants that have been reported in PD. The data have been standardized and complemented with variant classification, odds ratio if available, and other data. RESULTS: We found 371 GBA1 variants reported in PD: 22 mild, 84 severe, 3 risk variants, and 262 of unknown status. We created a browser containing up-to-date information on these variants (https://pdgenetics.shinyapps.io/GBA1Browser/). CONCLUSIONS: The classification and browser presented in this work should inform and support basic, translational, and clinical research on GBA1-PD. © 2023 International Parkinson and Movement Disorder Society.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,011 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».