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Enregistrement W4313490558 · doi:10.1101/2023.01.02.522503

Directed differentiation of human hindbrain neuroepithelial stem cells recapitulates cerebellar granule neurogenesis

2023· preprint· en· W4313490558 sur OpenAlexafffund
Biren M. Dave, Xin Chen, Fraser P. McCready, Jignesh Tailor, James Ellis, Xi Huang, Peter B. Dirks

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSick Kids FoundationCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenAutism Speaks
Mots-clésProgenitor cellNeurogenesisBiologyNeuroepithelial cellSonic hedgehogNeuroscienceHindbrainStem cellProgenitorPopulationCell biologyCellular differentiationNeural stem cellCentral nervous systemGeneticsSignal transductionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cerebellar granule neurons (CGNs) are the most abundant neurons in the human brain and modulate cerebellar output to the motor cortex. Dysregulation of CGN development underlies movement disorders and medulloblastomas. It is suspected that these disorders arise in progenitor states of the CGN lineage, for which human models are lacking. Here, we have differentiated human hindbrain neuroepithelial stem (hbNES) cells to CGNs in vitro using soluble growth factors, recapitulating key progenitor states in the lineage. We show that hbNES cells are not lineage committed and retain rhombomere 1 (r1) regional identity. Upon differentiation, hbNES cells first transit through a rhombic lip (RL) progenitor state at day 7, demonstrating human specific sub-ventricular cell identities. This RL state is followed by an ATOH1 + CGN progenitor state at day 14. By the end of a 56-day differentiation procedure, we obtain mature neurons expressing CGN markers GABA A a6 and vGLUT2. These neurons generate spontaneous and evoked action potentials. A small fraction of endpoint neurons were unipolar brush cells (UBC). We noted maintenance of a RL population throughout differentiation, as is consistent with human development. We show that sonic hedgehog (SHH) promotes γ-aminobutyric acid (GABA)-ergic lineage specification and is a positive regulator of CGN progenitor proliferation. Interestingly, we observed that functional neuronal maturation is impaired by either elevated or absent SHH signaling. Impaired maturation under high SHH levels represents the potential of our system to model cerebellar tumorigenesis. Further, our data suggest a potential pro-differentiation role of SHH within a certain concentration range. Our work is, to our knowledge, the first detailed temporal characterization of the complete human CGN lineage in vitro . Our system recapitulates developmentally relevant progenitor states and is a new tool to model this specific cerebellar lineage, and how it may be disrupted to cause human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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