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Enregistrement W4313529858 · doi:10.1016/j.jbc.2022.102863

Endoplasmic reticulum protein BIK binds to and inhibits mitochondria-localized antiapoptotic proteins

2023· article· en· W4313529858 sur OpenAlexafffund
Elizabeth J. Osterlund, Nehad Hirmiz, Dang Nguyen, James M. Pemberton, Qiyin Fang, David W. Andrews

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensMcMaster UniversitySunnybrook HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndoplasmic reticulumMitochondrionBcl-xLCell biologyMitochondrial apoptosis-induced channelApoptosisBiologyBcl-2 familyMutantUnfolded protein responseInner mitochondrial membraneProgrammed cell deathChemistryMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The proapoptotic BCL-2 homology (BH3)-only endoplasmic reticulum (ER)-resident protein BCL-2 interacting killer (BIK) positively regulates mitochondrial outer membrane permeabilization, the point of no return in apoptosis. It is generally accepted that BIK functions at a distance from mitochondria by binding and sequestering antiapoptotic proteins at the ER, thereby promoting ER calcium release. Although BIK is predominantly localized to the ER, we detect by fluorescence lifetime imaging microscopy-FRET microscopy, BH3 region-dependent direct binding between BIK and mitochondria-localized chimeric mutants of the antiapoptotic proteins BCL-XL and BCL-2 in both baby mouse kidney (BMK) and MCF-7 cells. Direct binding was accompanied by cell type-specific differential relocalization in response to coexpression of either BIK or one of its target binding partners, BCL-XL, when coexpressed in cells. In BMK cells with genetic deletion of both BAX and BAK (BMK-double KO), our data suggest that a fraction of BIK protein moves toward mitochondria in response to the expression of a mitochondria-localized BCL-XL mutant. In contrast, in MCF-7 cells, our data suggest that BIK is localized at both ER and mitochondria-associated ER membranes and binds to the mitochondria-localized BCL-XL mutant via relocalization of BCL-XL to ER and mitochondria-associated ER membrane. Rather than functioning at a distance, our data suggest that BIK initiates mitochondrial outer membrane permeabilization via direct interactions with ER and mitochondria-localized antiapoptotic proteins, which occur via ER-mitochondria contact sites, and/or by relocalization of either BIK or antiapoptotic proteins in cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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