MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313531520 · doi:10.1016/j.cmpb.2023.107334

An automatic pipeline for atlas-based fetal and neonatal brain segmentation and analysis

2023· article· en· W4313531520 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueComputer Methods and Programs in Biomedicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFetal and Pediatric Neurological Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGyrificationSegmentationPipeline (software)Computer scienceArtificial intelligenceMagnetic resonance imagingComputer visionPattern recognition (psychology)MedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVE: The automatic segmentation of perinatal brain structures in magnetic resonance imaging (MRI) is of utmost importance for the study of brain growth and related complications. While different methods exist for adult and pediatric MRI data, there is a lack for automatic tools for the analysis of perinatal imaging. METHODS: In this work, a new pipeline for fetal and neonatal segmentation has been developed. We also report the creation of two new fetal atlases, and their use within the pipeline for atlas-based segmentation, based on novel registration methods. The pipeline is also able to extract cortical and pial surfaces and compute features, such as curvature, local gyrification index, sulcal depth, and thickness. RESULTS: Results show that the introduction of the new templates together with our segmentation strategy leads to accurate results when compared to expert annotations, as well as better performances when compared to a reference pipeline (developing Human Connectome Project (dHCP)), for both early and late-onset fetal brains. CONCLUSIONS: These findings show the potential of the presented atlases and the whole pipeline for application in both fetal, neonatal, and longitudinal studies, which could lead to dramatic improvements in the understanding of perinatal brain development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle