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Enregistrement W4313594739 · doi:10.1016/j.biocon.2022.109883

The application gap: Genomics for biodiversity and ecosystem service management

2023· article· en· W4313594739 sur OpenAlexafffund
Myriam Heuertz, Sílvia B. Carvalho, Juan Galindo, Baruch Rinkevich, Piotr Robakowski, Tsipe Aavik, İlhan Altınok, Julia M. I. Barth, Helena Cotrim, Roos Goessen, Santiago C. González‐Martínez, Tine Grebenc, Sean Hoban, Alexander Kopatz, Barry J. McMahon, Ilga Porth, Joost A. M. Raeymaekers, Sabrina Träger, Alejandro Valdecantos, Adriana Vella, Cristiano Vernesi, Pauline Garnier‐géré

Notice bibliographique

RevueBiological Conservation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesHorizon 2020Fonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFundação para a Ciência e a TecnologiaH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsCentro Singular de Investigación de GaliciaXunta de GaliciaEuropean Regional Development FundEuropean CommissionGutenberg ForschungskollegJavna Agencija za Raziskovalno Dejavnost RSGeneralitat ValencianaMinisterio de Ciencia e InnovaciónEuropean Cooperation in Science and Technology
Mots-clésBiodiversityEcosystem servicesEnvironmental resource managementBusinessGenomicsEnvironmental planningEcosystemEcologyBiologyGeographyGenomeEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The conservation of biodiversity from the genetic to the community levels is fundamental for the continual provision of ecosystem services (ES), the benefits that ecosystems provide to people. Genetic and genomic diversity enhance the resilience of populations and communities that underpin the provision of ecosystem functions and services. We show that genomics applications are mostly limited to flagship species and that their benefits for biodiversity conservation and ES management are underachieved. We propose a framework on how genomics applications can guide management for biodiversity conservation and sustainable ES to bridge this genomics-ES management ‘application gap’. We review how genomic knowledge in single species (relatedness, potentially adaptive variants) or in interacting species (host-microorganism coevolution, hybridization) can guide effective management actions. These include population supplementation, assisted migration or hybridization to promote climate-adapted variants or adaptive potential, control of invasives, delimitation of conservation or management areas, provenancing strategies for restoration, managing microbial function and solving conservation and ES trade-offs. Genomics-informed management actions for improved conservation and ES outcomes are supported through synergies between scientists and ES managers at local, regional and international levels, through the development of standardized genomic workflows, training to ES managers and incorporation of local information. Such actions facilitate the implementation of biodiversity conservation and ES policies such as the UN 2030 sustainable development goals and the EU Biodiversity strategy for 2030, and support the inclusion of ambitious biodiversity conservation goals in the development of new policies such as the CBD post-2020 Global Biodiversity Framework or conservation policies on hybrids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,103

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,008
Communication savante0,0080,018
Science ouverte0,0020,007
Intégrité de la recherche0,0120,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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