Isolation of <i>Pikps</i>, an allele of <i>Pik</i>, from the <i>aus</i> rice cultivar Shoni
Notice bibliographique
Résumé
Blast disease caused by the filamentous fungus Pyricularia oryzae (syn. Magnaporthe oryzae) is one of the most destructive diseases of rice (Oryza sativa L.) around the globe. An aus cultivar, Shoni, showed resistance against at least four Japanese P. oryzae isolates. To understand Shoni's resistance against the P. oryzae isolate Naga69-150, genetic analysis was carried out using recombinant inbred lines developed by a cross between Shoni and the japonica cultivar Hitomebore, which is susceptible to Naga69-150. The result indicated that the resistance was controlled by a single locus, which was named Pi-Shoni. A QTL analysis identified Pi-Shoni as being located in the telomeric region of chromosome 11. A candidate gene approach in the region indicated that Pi-Shoni corresponds to the previously cloned Pik locus, and we named this allele Pikps. Loss of gene function mediated by RNA interference demonstrated that a head-to-head-orientated pair of NBS-LRR receptor genes (Pikps-1 and Pikps-2) are required for the Pikps-mediated resistance. Amino acid sequence comparison showed that Pikps-1 is 99% identical to Pikp-1, while Pikps-2 is identical to Pikp-2. Pikps-1 had one amino acid substitution (Pro351Ser) in the NBS domain as compared to Pikp-1. The recognition specificity of Pikps against known AVR-Pik alleles is identical to that of Pikp.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».