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Enregistrement W4313648862 · doi:10.1080/07060661.2023.2166126

Virulence characterization of the wheat stripe rust pathogen, <i>Puccinia striiformis</i> f. sp. <i>tritici</i> , in Turkey from 2018 to 2020

2023· article· en· W4313648862 sur OpenAlexvenueno aff
Ahmet Çat, Mehmet Tekin, Kadir Akan, Taner Akar, Mürsel Çatal

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuWashington State University
Mots-clésVirulenceBiologyStripe rustPuccinia striiformisPathogenRace (biology)CultivarPopulationObligate parasiteVeterinary medicinePlant disease resistanceGeneBotanyGeneticsHost (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stripe (yellow) rust caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) is the most devastating disease of wheat in Turkey. Virulence characterization of the Pst population is critical to prevent large-scale epidemics, by developing wheat cultivars with durable resistance against the disease. In this study, 38 Pst races, including 25 races that were not previously reported, were identified from 140 isolates obtained from most regions of Turkey from 2018 to 2020 using a differential set containing 18 single Yr gene wheat lines (NILs) of ‘Avocet’. Virulence to Yr15 was not observed among any of the isolates. Virulence to the remaining 17-Yr genes was detected at various frequencies. The frequencies of virulence to Yr6, Yr9, Yr7, Yr8, Yr43, YrExp2, Yr44, YrTr1, and Yr27 were high (57.1 to 100.0%), to Yr1, Yr17, Yr32, and YrTye were moderate (24.3 to 42.9%), and to YrSP, Yr24, and Yr10 were low (9.3 to 17.1%). Only one race was virulent to Yr5 (0.7%). Many of the races identified were common among regions, indicating that Pst races migrate throughout Turkey. However, the Black Sea (BS) and the Mediterranean (ME) regions were differentiated from other regions by unique races absent in other regions, and the Yr5-virulent race, respectively. To sum up, the virulences of the races identified and their distributions among regions provided an understanding of pathogen migration and may contribute to the development of resistant wheat cultivars against stripe rust.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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