MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4313816321 · doi:10.1158/1538-7755.disp22-c036

Abstract C036: Correlation of Kaiso and androgen receptor expression in women of African ancestry with triple-negative breast cancer

2023· article· en· W4313816321 sur OpenAlexaff
Stephanie Ali Fairbairn, Robert W. Cowan, Juliet M. Daniel, Shawn M. Hercules

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTriple-negative breast cancerAndrogen receptorBreast cancerTissue microarrayCancer researchOncologyCancerImmunohistochemistryMetastasisTranscription factorMedicineInternal medicineBiologyProstate cancerGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Breast cancer (BCa) is the most frequently diagnosed female cancer and a leading cause of female deaths worldwide, regardless of increased awareness and improved therapies. Triple-negative breast cancer (TNBC) is one of the most challenging BCa subtypes as it is highly heterogeneous, metastatic in nature and has limited targeted therapies. TNBC is most prevalent in young women of African ancestry (WAA), who despite having lower BCa rates, have a disproportionately higher mortality rate compared to women of European ancestry (WEA). However, the cause for this racial disparity is currently unknown, thus highlighting the importance of unraveling the genetic and molecular factors that contribute to TNBC in WAA. Our lab previously showed that the transcription factor Kaiso may be linked to this disparity as it contributes to increased metastasis and mortality in WAA TNBC patients. Interestingly, multiple studies have indicated that WAA TNBC tissues also express less Androgen Receptor (AR) than WEA TNBC tissues, supporting the existence of a novel BCa subtype – quadruple-negative breast cancer (QNBC). Notably, in silico analysis revealed several Kaiso binding sites in the AR promoter region, and that high Kaiso and low AR expression correlated with poorer overall survival in BCa patients. Thus, we hypothesized that high Kaiso and low AR expression could be contributing to the increased mortality in WAA with TNBC. This study seeks to examine the relationship between Kaiso and AR, the clinical significance of this relationship and its role, if any, in TNBC racial disparities. Using tissue microarrays (TMAs) and immunohistochemistry (IHC), we found reduced and cytoplasmic AR expression in WAA compared to WEA. Moreover, preliminary findings from western blot analyses showed an increase in AR expression in response to Kaiso depletion in TNBC cells. These findings suggest that AR could be a bona fide Kaiso target gene and that there may be clinical relevance of high Kaiso, and low AR expression in BCa survival, especially in patients with an African heritage. Ongoing experiments are focused on determining if Kaiso directly associates with the endogenous AR promoter region and discerning the link between high Kaiso and low AR expression in TNBC racial disparities. A significant correlation between Kaiso and AR expression will help to validate the existence of QNBC in WAA and support Kaiso and AR as clinically relevant prognostic markers for TNBC, especially in WAA. Citation Format: Stephanie Ali Fairbairn, Robert Cowan, Juliet M. Daniel, Shawn M. Hercules. Correlation of Kaiso and androgen receptor expression in women of African ancestry with triple-negative breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the 15th AACR Conference on the Science of Cancer Health Disparities in Racial/Ethnic Minorities and the Medically Underserved; 2022 Sep 16-19; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2022;31(1 Suppl):Abstract nr C036.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Epidemiology Biomarkers & PreventionMême sujetProstate Cancer Treatment and ResearchTravaux en français237 207