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Enregistrement W4313824486 · doi:10.3390/ijms24021262

Shifting Paradigm from Gene Expressions to Pathways Reveals Physiological Mechanisms in Blood Pressure Control in Causation

2023· article· en· W4313824486 sur OpenAlexafffund
Alan Y. Deng, Annie Ménard, David W. Deng

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyGeneticsMendelian inheritanceCongenicPleiotropyGenePolygenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetics for blood pressure (BP) in human and animals has been partitioned into two separate specialties. However, this divide is mechanistically-misleading. BP physiology is mechanistically participated by products of quantitative trait loci (QTLs). The key to unlocking its mechanistic mystery lies in the past with mammalian ancestors before humans existed. By pivoting from effects to causes, physiological mechanisms determining BP by six QTLs have been implicated. Our work relies on congenic knock-in genetics in vivo using rat models, and has reproduced the physiological outcome based on a QTL being molecularly equal to one gene. A gene dose for a QTL is irrelevant to physiological BP controls in causation. Together, QTLs join one another as a group in modularized Mendelian fashion to achieve polygenicity. Mechanistically, QTLs in the same module appear to function in a common pathway. Each is involved in a different step in the pathway toward polygenic hypertension. This work has implicated previously-concealed components of these pathways. This emerging concept is a departure from the human-centric precept that the level of QTL expressions, not physiology, would ultimately determine BP. The modularity/pathway paradigm breaks a unique conceptual ground for unravelling the physiological mechanisms of polygenic and quantitative traits like BP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,023
Communication savante0,0030,008
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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