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Enregistrement W4313891634 · doi:10.1101/2023.01.08.523183

Engineering <i>Escherichia coli</i> to produce aromatic chemicals from ethylene glycol

2023· preprint· en· W4313891634 sur OpenAlexaff
Smaranika Panda, Jie Zhou, Michelle Feigis, Emma Harrison, Xiaoqiang Ma, Vincent Fung Kin Yuen, Radhakrishnan Mahadevan, Kang Zhou

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Research Foundation SingaporeNational Research Foundation
Mots-clésEscherichia coliChemistryFermentationEthylene glycolGlycerolAromatic amino acidsHydrolysisCellulosic ethanolRaw materialOrganic chemistryMetabolic engineeringYield (engineering)PhenylalanineSubstrate (aquarium)SugarBiochemistryCelluloseMaterials scienceAmino acidEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Microbial overproduction of aromatic chemicals has gained considerable industrial interest and various metabolic engineering approaches have been employed in recent years to address the associated challenges. So far, most studies have used sugars (mostly glucose) or glycerol as the primary carbon source. In this study, we used ethylene glycol (EG) as the main carbon substrate. EG could be obtained from the degradation of plastic and cellulosic wastes. As a proof of concept, Escherichia coli was engineered to transform EG into L-tyrosine, a valuable aromatic amino acid. Under the best fermentation condition, the strain produced 2 g/L L-tyrosine from 10 g/L EG at approximately 50% of the theoretical yield, outperforming glucose (the most common sugar feedstock) in the same experimental conditions. To prove the concept that EG can be converted into different aromatic chemicals, E. coli was further engineered with a similar approach to synthesize other valuable aromatic chemicals, L-phenylalanine and p -coumaric acid. Finally, waste polyethylene terephthalate (PET) bottles were degraded using acid hydrolysis and the resulting monomer EG was transformed into L-tyrosine using the engineered E. coli , yielding a comparable titer to that obtained using commercial EG. The strains developed in this study should be valuable to the community for producing valuable aromatics from EG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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