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Enregistrement W4313909974 · doi:10.1093/rheumatology/kead002

Prediction of damage trajectories in systemic sclerosis using group-based trajectory modelling

2023· article· en· W4313909974 sur OpenAlexafffundabout
Murray Baron, Ariane Barbacki, Ada Man, Jeska K de Vries‐Bouwstra, Dylan Johnson, Wendy Stevens, Mohammed Osman, Mianbo Wang, Yuqing Zhang, Joanne Sahhar, Gene‐Siew Ngian, Susanna Proudman, Mandana Nikpour, Geneviève Gyger, Sophie Ligier, Janet Pope, Maggie Larché, Nader Khalidi, A Massetto, Emily Sutton, T.S. Rodríguez-Reyna, Carter Thorne, Paul R. Fortin, Alena Ikic, David Robinson, Nicola Jones, Sharon LeClercq, Paul D. Docherty, D.P. Smith, Maysan Abu-Hakima, Elżbieta Kamińska, Marvin J. Fritzler, Nava Ferdowsi, Kathleen Morrisroe, Laura Ross, Jennifer Walker, Janet Roddy, Lauren Host, Gabor Major

Notice bibliographique

RevueLara D. Veeken · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Sclerosis and Related Diseases
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of ManitobaJewish General Hospital
Organismes subventionnairesActelion PharmaceuticalsScleroderma Association of British ColumbiaCanadian Institutes of Health ResearchScleroderma Society of OntarioJewish General Hospital
Mots-clésMedicineCohortTrajectoryScleroderma (fungus)AccrualStatisticsInternal medicineMathematicsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Damage accrual in SSc can be tracked using the Scleroderma Clinical Trials Consortium Damage Index (DI). Our goal was to develop a prediction model for damage accrual in SSc patients with early disease. METHODS: Using patients with <2 years disease duration from Canada and Australia as a derivation cohort, and from the Netherlands as a validation cohort, we used group-based trajectory modelling (GBTM) to determine 'good' and 'bad' latent damage trajectories. We developed a prediction model from this analysis and applied it to patients from derivation and validation cohorts. We plotted the actual DI trajectories of the patients predicted to be in 'good' or 'bad' groups. RESULTS: We found that the actual trajectories of damage accumulation for lcSSc and dcSSc were very different, so we studied each subset separately. GBTM found two distinct trajectories in lcSSc and three in dcSSc. We collapsed the two worse trajectories in the dcSSc into one group and developed a prediction model for inclusion in either 'good' or 'bad' trajectories. The performance of models using only baseline DI and sex was excellent with ROC AUC of 0.9313 for lcSSc and 0.9027 for dcSSc. Using this model, we determined whether patients would fall into 'good' or 'bad' trajectory groups and then plotted their actual trajectories which showed clear differences between the predicted 'good' and 'bad' cases in both derivation and validation cohorts. CONCLUSIONS: A simple model using only cutaneous subset, baseline DI and sex can predict damage accumulation in early SSc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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