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Enregistrement W4313910225 · doi:10.1097/pai.0000000000001095

Reinventing Nuclear Histo-score Utilizing Inherent Morphologic Cutoffs: Blue-brown Color H-score (BBC-HS)

2023· article· en· W4313910225 sur OpenAlexaff
Phillipe Price, Usharani Ganugapati, Zoran Gatalica, Archan Kakadekar, James Macpherson, Louise Quenneville, Henrike Rees, Elzbieta Slodkowska, Janarthanee Suresh, Darryl Yu, Hyun J. Lim, Emina Torlakovic

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreUniversity of OttawaSaskatchewan Health AuthorityUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStainStainingImmunohistochemistryH&E stainCutoffIntraclass correlationPathologyMedicineKappaNuclear medicineInternal medicineMathematicsPhysicsClinical psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immunohistochemistry (IHC) is a testing methodology that is widely used for large number of diagnostic, prognostic, and predictive biomarkers. Although IHC is a qualitative methodology, in addition to threshold-based stratification (positive vs. negative), the increasing levels of expression of some of these biomarkers often lead to more intense staining, which published evidence linked to specific diagnosis, prognosis, and responses to therapy. It is essential that the descriptive thresholds between positive and negative staining, as well as between frequently used graded categories of staining intensity (eg, 1+, 2+, 3+) are standardized and reproducible. Histo-score (H-score) is a frequently used scoring system that utilizes these categories. Our study introduces categorization of the cutoff points between positive and negative results and graded categories of staining intensity for nuclear IHC biomarker assays based on color interaction between hematoxylin and diaminobenzidine (DAB); the Blue-brown Color H-score (BBC-HS). Six cases of diffuse large B-cell lymphoma were stained for a nuclear marker MUM1. The staining was assessed by H-score by 12 readers. Short tutorial and illustrated instructions were provided to readers. The novel scoring system in this study uses the interaction between DAB (DAB, brown stain) and hematoxylin (blue counterstain) to set thresholds between "0" (negative nuclei), "1+" (weakly positive nuclei), "2+" (moderately positive nuclei), and "3+" (strongly positive nuclei). The readers recorded scores for 300 cells. Krippendorff alpha (K-alpha) and intraclass correlation coefficient (ICC) were calculated. We have also assessed if reliability improved when counting the first 100 cells, first 200 cells, and for the total 300 cells using K-alpha and ICC. To assess the performance of each individual reader, the mean H-score and percent positive score (PPS) for each case was calculated, and the bias was calculated between each reader's score and the mean. K-alpha was 0.86 for H-score and 0.76 for PPS. ICC was 0.96 for H-score and 0.92 for PPS. The biases for H-score ranged from -58 to 41, whereas for PPS it ranged from -27% to 33%. Overall, most readers showed very low bias. Two readers were consistently underscoring and 2 were consistently overscoring compared with the mean. For nuclear IHC biomarker assays, our newly proposed cutoffs provide highly reliable/reproducible results between readers for positive and negative results and graded categories of staining intensity using existing morphologic parameters. BBC-HS is easy to teach and is applicable to both human eye and image analysis. BBC-HS application should facilitate the development of new reliable/reproducible scoring schemes for IHC biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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