Editorial: Untapped metabolic diversity in legume-characteristic pathways
Notice bibliographique
Résumé
Specialized metabolism in legume species -Defense and medicinal compoundsIn this special issue, new insights are found into the specialized metabolism of legumes and the gene families that play a significant role in defence and stress response.Plant defence is strictly regulated to allocate resources when and where needed, including an arsenal of constitutively expressed first responders and bioactive derivatives (phytoalexins) deployed de novo (VanEtten et al., 1994).From the perception of stress, damage, or infection, an intricate signalling cascade is triggered, via phytohormones, rendering changes, including cell wall modifications (Lionetti et al., 2007), metabolic shifts (Simons et al., 2011;Sukumaran et al., 2018), and the biosynthesis of specialized defence compounds (Förster et al., 2022).Researchers in this special issue have probed the underlying molecular factors responding to stresses, including salt and mercury stress ( Wanget al.; Alvarez-Rivera et al.) and Phytophthora sojae infection (Khatri et al.), as well as transport mechanisms for sequestration of specialized metabolites (Islam et al.).They have also developed metabolo-transcriptomic databases to investigate medicinal plants (Lin et al.) and leveraged these pathways via plant/heterologous culture bioreactors (Istiandari et al.; Lee et al.).Deep understanding of this metabolic "design space," using the resources reported in this issue, can help us tap into the potential of plant specialized metabolism and eventually move beyond the plant as a host or its catalogue of compounds.Two papers in this issue discuss the merits of the medicinal legume Glycyrrhiza uralensis or Chinese licorice (Istiandari et al.; Wang et al.).This plant has rhizomes that can be harvested in early autumn, dried, and pounded into a saccharine powder, 50 times sweeter than sugar (Glykys, meaning sweet in Greek).This natural demulcent has a soothing effect on the digestive tract.Glycyrrhiza species are also a source of myriad legume-characteristic metabolites, notably including glycyrrhizin, a saponin molecule.Environmental stresses, including salinity, can impact the composition and content of these roots (Behdad et al., 2020).Therefore, Wang et al. used an integrated metabolo- Frontiers in Plant Science frontiersin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,010 | 0,012 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,024 | 0,013 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».