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Enregistrement W4315490127 · doi:10.1101/2023.01.10.523203

LZTR1 polymerization provokes cardiac pathology in recessive Noonan syndrome

2023· preprint· en· W4315490127 sur OpenAlexfundno aff
Alexandra Viktoria Busley, Óscar Gutiérrez‐Gutiérrez, Elke Hammer, Fabian Koitka, Amin Mirzaiebadizi, Martin Steinegger, Constantin Pape, Linda Böhmer, Henning Schroeder, Mandy Kleinsorge, Melanie Engler, Ion Cristian Cirstea, Lothar Gremer, Dieter Willbold, Janine Altmüller, Felix Marbach, Gerd Hasenfuß, Wolfram‐Hubertus Zimmermann, Mohammad Reza Ahmadian, Bernd Wollnik, Lukas Cyganek

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsBundesministerium für Bildung und ForschungFondation LeducqDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversitätsmedizin GöttingenDeutsches Zentrum für Herz-Kreislaufforschung
Mots-clésMissense mutationNoonan syndromeBiologyPhenotypeBioinformaticsCancer researchGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Noonan syndrome patients harboring causative variants in LZTR1 are particularly at risk to develop severe and early-onset hypertrophic cardiomyopathy. However, the underling disease mechanisms of LZTR1 missense variants driving the cardiac pathology are poorly understood. Hence, therapeutic options for Noonan syndrome patients are limited. In this study, we investigated the mechanistic consequences of a novel homozygous causative variant LZTR1 L580P by using patient-specific and CRISPR/Cas9-corrected iPSC-cardiomyocytes. Molecular, cellular, and functional phenotyping in combination with in silico prediction of protein complexes uncovered a unique LZTR1 L580P -specific disease mechanism provoking the cardiac hypertrophy. The homozygous variant was predicted to alter the binding affinity of the dimerization domains facilitating the formation of linear LZTR1 polymer chains. The altered polymerization resulted in dysfunction of the LZTR1-cullin 3 ubiquitin ligase complexes and subsequently, in accumulation of RAS GTPases, thereby provoking global pathological changes of the proteomic landscape ultimately leading to cellular hypertrophy. Furthermore, our data showed that cardiomyocyte-specific MRAS degradation is mediated by LZTR1 via the autophagosome, whereas RIT1 degradation is mediated by both LZTR1-dependent and LZTR1-independent proteasomal pathways. Importantly, uni-or biallelic genetic correction of the LZTR1 L580P missense variant rescued the molecular and cellular disease-associated phenotype, providing proof-of-concept for CRISPR-based gene therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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