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Enregistrement W4315490334 · doi:10.26685/urncst.433

Introduction of Mutant APOBEC3G Into CD4+ T-Cells to Resist HIV-1

2023· article· en· W4315490334 sur OpenAlexaff
Ali Salman, AbedAlAziz AlTawabini, Basel Mohamed, Sarah Duraid

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAPOBEC3GBiologyVirologyMutantCytidine deaminaseViral replicationRetrovirusReverse transcriptaseMutationStem cellMolecular biologyCell biologyVirusImmunologyAntibodyGeneticsGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) is a potentially lethal retrovirus with high genetic diversity and replication ability. HIV-1 mainly targets human CD4+ T-cells, causing a rapid decline in CD4+ T-cell count after infection. Apolipoprotein B mRNA Editing Enzyme Catalytic Subunit 3G (APOBEC3G or A3G) is a human anti-viral enzyme that blocks early stages of HIV-1 replication by deaminating the cytosine residues to uracil in the viral minus-strand DNA during reverse transcription. Nevertheless, HIV-1 overcomes A3G anti-viral activity by employing Vif accessory protein to degrade A3G. Due to a proline/aspartate point mutation in residue 129 (P129D), an artificial A3G mutant, also known as A3G-P129D, was found to be resistant against diverse Vif variants, including HIV-1 Vif, thereby shedding light on a potential A3G-mediated gene therapy for HIV-1. Methods: We propose that, using CRISPR-Cas9 tools, the P129D mutation will be introduced into A3G expressed by human hematopoietic stem cells. Engineered stem cells will be transplanted into Non-Obese Diabetic Severe Combined Immunodeficient Gamma (NSG) mice, which will later be infected with HIV-1. Following infection, flow cytometry will be used to compare the CD4+ T-cell count in mice that express A3G-P129D versus control mice transplanted with unmodified human CD4+ T-cells. Results: We expect a notably higher CD4+ T-cell count in mice carrying the P129D mutation than in the control group, which would be attributed to the efficient inhibition of HIV-1 replication by the mutant A3G. Discussion: Transforming human A3G to A3G-P129D will prevent Vif-mediated degradation of A3G, allowing A3G to efficiently target HIV-1. Thus, this treatment would ultimately block HIV-1 replication and prevent CD4+ T-cell depletion. Conclusion: Overall, our novel gene therapy approach could open the door to a potential one-time treatment for HIV-1 infected patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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