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Enregistrement W4315620057 · doi:10.1002/acm2.13904

Stability of dosiomic features against variations in dose calculation: An analysis based on a cohort of prostate external beam radiotherapy patients

2023· article· en· W4315620057 sur OpenAlexaff
Lingyue Sun, Wendy M. Smith, Charles Kirkby

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Clinical Medical Physics · 2023
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensFoothills Medical CentreUniversity of LethbridgeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNuclear medicineDosimetryRetrospective cohort studyMedicineRadiation therapyFeature (linguistics)Radiation treatment planningStability (learning theory)MathematicsStatisticsAlgorithmComputer scienceRadiologySurgeryMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Interest in using higher order features of the planned 3D dose distributions (i.e., dosiomics) to predict radiotherapy outcomes is growing. This is driving many retrospective studies where historical data are mined to train machine learning models; however, recent decades have seen considerable advances in dose calculation that could have a direct impact on the dosiomic features such studies seek to extract. Is it necessary to recalculate planned dose distributions using a common algorithm if retrospective datasets from different institutions are included? Does a change in dose calculation grid size part way through a retrospective cohort, introduce bias in the extracted dosiomic features? The purpose of this study is to assess the stability of dosiomic features against variations in three factors: the dose calculation algorithm type, version, and dose grid size. METHODS: Dose distributions for 27 prostate patients who received EBRT were recalculated in the Eclipse Treatment Planning System (Varian Medical Systems, Palo Alto, California, USA) using two algorithms (AAA and Acuros XB), two versions (version 13.6 and 15.6), and three dose grids (2, 2.5 s, and 3 mm) - 12 dose distributions for each patient. Ninety-three dosiomic features were extracted from each dose distribution and each of the following regions-of-interest: high dose PTV (PTV_High), 1 cm rind around PTV_High (PTV_Ring), low dose PTV (PTV_Low), rectum, and bladder using PyRadiomics. The coefficient of variation (CV) was calculated for each dosiomic feature. Hierarchical clustering was used to group features with high and low variability. Three-way repeated measures ANOVA was performed to investigate the effect of the three different factors on dosiomic features that were classified with high variation. Additionally, CVs were calculated for cumulative dose volume histograms (DVHs) to test their ability to detect the variations in dose distributions. RESULTS: For PTV_Ring, PTV_Low, and rectum, all the dosiomic features had low CV (average CV ≤ 0.26) across the varying dose calculation conditions. For PTV_High, six dosiomic features showed CV > 0.26, and dose calculation algorithm type and grid size were the major sources of within-patient variation. For bladder, one dosiomic feature had average CV > 0.26, but none of the three dose calculation-related factors led to a statistically significant variation. The CVs for all the DVHs were very small (CV < 0.05). CONCLUSION: For all the regions-of-interest examined in this study, the majority of the dosiomic features were stable against variations in dose calculation; however, some of the dosiomic features for PTV_High and bladder had significant variations due to differences in dose calculation details. DVHs were detecting less variation than dosiomic features.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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