MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4315630296 · doi:10.1016/j.ajt.2022.12.002

Machine learning–based mortality prediction models using national liver transplantation registries are feasible but have limited utility across countries

2023· article· en· W4315630296 sur OpenAlexaff
Tommy Ivanics, Delvin So, Marco P. A. W. Claasen, David Wallace, Madhukar S. Patel, Annabel Gravely, Woo Jin Choi, Chaya Shwaartz, Kate Walker, Lauren Erdman, Gonzalo Sapisochín

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOrgan Transplantation Techniques and Outcomes
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNHS Blood and Transplant
Mots-clésMedicineLiver transplantationReceiver operating characteristicTransplantationMachine learningDemographyInternal medicineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many countries curate national registries of liver transplant (LT) data. These registries are often used to generate predictive models; however, potential performance and transferability of these models remain unclear. We used data from 3 national registries and developed machine learning algorithm (MLA)-based models to predict 90-day post-LT mortality within and across countries. Predictive performance and external validity of each model were assessed. Prospectively collected data of adult patients (aged ≥18 years) who underwent primary LTs between January 2008 and December 2018 from the Canadian Organ Replacement Registry (Canada), National Health Service Blood and Transplantation (United Kingdom), and United Network for Organ Sharing (United States) were used to develop MLA models to predict 90-day post-LT mortality. Models were developed using each registry individually (based on variables inherent to the individual databases) and using all 3 registries combined (variables in common between the registries [harmonized]). The model performance was evaluated using area under the receiver operating characteristic (AUROC) curve. The number of patients included was as follows: Canada, n = 1214; the United Kingdom, n = 5287; and the United States, n = 59,558. The best performing MLA-based model was ridge regression across both individual registries and harmonized data sets. Model performance diminished from individualized to the harmonized registries, especially in Canada (individualized ridge: AUROC, 0.74; range, 0.73-0.74; harmonized: AUROC, 0.68; range, 0.50-0.73) and US (individualized ridge: AUROC, 0.71; range, 0.70-0.71; harmonized: AUROC, 0.66; range, 0.66-0.66) data sets. External model performance across countries was poor overall. MLA-based models yield a fair discriminatory potential when used within individual databases. However, the external validity of these models is poor when applied across countries. Standardization of registry-based variables could facilitate the added value of MLA-based models in informing decision making in future LTs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,050
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,077

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,050
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of TransplantationMême sujetOrgan Transplantation Techniques and OutcomesTravaux en français237 207