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Enregistrement W4315631006 · doi:10.1159/000528350

Using a Two-Sample Mendelian Randomization Study Based on Genome-Wide Association Studies to Assess and Demonstrate the Causal Effects of Allergic Rhinitis on Chronic Lower Respiratory Diseases and Lung Function

2023· review· en· W4315631006 sur OpenAlexaff
Zengxiao Zhang, Gongfei Li, Longgang Yu, Jiaxin Jiang, Shizhe Zhou, Yan Jiang

Notice bibliographique

RevueInternational Archives of Allergy and Immunology · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesKey Technology Research and Development Program of ShandongNational Natural Science Foundation of ChinaEuropean Bioinformatics Institute
Mots-clésMendelian randomizationMedicineAsthmaCOPDBronchiectasisOdds ratioInternal medicineLung cancerGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismImmunologyLungGenotypeBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Observational studies have reported that allergic rhinitis (AR) was associated with chronic lower respiratory diseases (CLRDs) and lung function; however, their causal effects remain elusive. Therefore, to investigate the causal effects of AR on CLRDs and lung function, we conducted the two-sample Mendelian randomization (MR) study. METHODS: The data for AR, asthma, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), bronchiectasis, idiopathic pulmonary fibrosis (IPF), and the forced expiratory volume in 1 s (FEV1)/forced vital capacity (FVC) ratio were obtained from genome-wide association studies, which were large sample studies on people of European ancestry. In this study, single-nucleotide polymorphisms associated with AR were considered instrumental variables. We employed the inverse-variance weighted (IVW) method with random effects to evaluate causal effects, and the weighted median and MR-Egger methods were used for sensitivity analyses. Significant causal associations were attempted for replication and meta-analysis. RESULTS: In the discovery stage, we found that AR exhibited a significant causal effect on asthma (IVW, odds ratio [OR] = 16.91, 95% CI, 8.03-35.65, p < 0.001) and a suggestive effect on FEV1/FVC ratio (IVW, OR = 0.82, 95% CI, 0.68-0.99, p = 0.039). No causal effect of AR was observed on COPD, bronchiectasis, and IPF. In the replication stage, the causal effect of AR on asthma was replicated (IVW, OR = 11.57, 95% CI, 4.90-27.37, p < 0.001). The meta-analysis demonstrated that the combined OR of AR on asthma was 14.37 (IVW, 95% CI, 8.18-25.24, p < 0.001). CONCLUSIONS: We demonstrated and measured the causal effects of AR on asthma (OR = 14.37) and FEV1/FVC ratio (OR = 0.82), while there was no evidence to support a causal effect of AR on COPD, bronchiectasis, and IPF. These results suggest that AR tends to have a causal effect on lower airway disease of similar inflammatory types and can provide high-quality causal evidence for clinical practice as well as the pathogenesis and prevention of AR and asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,071
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,128
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,377

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0710,128
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,008
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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