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Enregistrement W4315750437 · doi:10.1101/2023.01.10.23284296

The SENSOR System: Using Standardized Data Entry and Dashboards for Review of Scientific Studies on the Utility of Blood-Based Protein Biomarkers for Patients with Mild Brain Injury

2023· preprint· en· W4315750437 sur OpenAlexaff
Salena Aggerwal, Toufik Safi, Lt Peter Beliveau, Gaurav Gupta

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Arrest and Resuscitation
Établissements canadiensCanadian Armed ForcesUniversity of TorontoUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésContext (archaeology)Traumatic brain injuryBiomarkerDashboardConfoundingDemographicsData presentationMedicineComputer scienceMedical physicsPathologyData sciencePsychiatryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background There is no objective way of diagnosing or prognosticating acute traumatic brain injuries (TBIs). A systematic review conducted by Mondello et al . reviewed studies looking at blood based protein biomarkers in the context of acute mild traumatic brain injuries and correlation to results of computed tomography scanning. This paper provides a summary of this same literature using the SENSOR system. Methods An existing review written by Mondello et al . was selected to apply the previously described SENSOR system (Kamal et al.) that uses a systematic process made up of a Google Form for data intake, Google Drive for article access, and Google Sheets for the creation of the dashboard. The dashboard consisted of a map, bubble graphs, multiple score charts, and a pivot table to facilitate the presentation of data. Results A total of 29 entries were inputted by two team members. Sensitivities, specificities, positive predictive values (PPVs), negative predictive values (NPVs), demographics, cut-off levels, biomarker levels, and assay ranges were analyzed and presented in this study. S100B and GFAP biomarkers may provide good clinical utility, whereas UCH-L1, C-Tau, and NSE do not. Discussion This study determined the feasibility and reliability of multiple biomarkers (S100B, UCH-L1, GFAP, C-tau, and NSE) in predicting traumatic brain lesions on CT scans, in mTBI patients, using the SENSOR system. Many potential limitations exist for the existing literature including controlling for known confounders for mild traumatic brain injuries. Conclusion The SENSOR system is an adaptable, dynamic, and graphical display of scientific studies that has many benefits, which may still require further validation. Certain protein biomarkers may be helpful in deciding which patients with mTBIs require CT scans, but impact on prognosis is still not clear based on the available literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,098
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,236
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0980,236
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,007
Bibliométrie0,0380,028
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0030,007
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0230,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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