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Enregistrement W4315754436 · doi:10.1002/jrsm.1620

<scp>SeroTracker‐RoB</scp> : A decision rule‐based algorithm for reproducible risk of bias assessment of seroprevalence studies

2023· article· en· W4315754436 sur OpenAlexafffund
Niklas Bobrovitz, Kim C. Noël, Zihan Li, Christian Cao, Gabriel Deveaux, Anabel Selemon, David A. Clifton, Mercedes Yanes‐Lane, Tingting Yan, Rahul K. Arora

Notice bibliographique

RevueResearch Synthesis Methods · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of WaterlooUniversity of TorontoMcGill University Health CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesRobert Koch InstitutCanadian Medical AssociationPublic Health Agency of CanadaWorld Health Organization
Mots-clésReliability (semiconductor)AlgorithmComputer scienceChecklistIntraclass correlationCritical appraisalSet (abstract data type)Data miningMathematicsStatisticsMedicinePsychologyPsychometrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Risk of bias (RoB) assessments are a core element of evidence synthesis but can be time consuming and subjective. We aimed to develop a decision rule-based algorithm for RoB assessment of seroprevalence studies. We developed the SeroTracker-RoB algorithm. The algorithm derives seven objective and two subjective critical appraisal items from the Joanna Briggs Institute Critical Appraisal Checklist for Prevalence studies and implements decision rules that determine study risk of bias based on the items. Decision rules were validated using the SeroTracker seroprevalence study database, which included non-algorithmic RoB judgments from two reviewers. We quantified efficiency as the mean difference in time for the algorithmic and non-algorithmic assessments of 80 randomly selected articles, coverage as the proportion of studies where the decision rules yielded an assessment, and reliability using intraclass correlations comparing algorithmic and non-algorithmic assessments for 2070 articles. A set of decision rules with 61 branches was developed using responses to the nine critical appraisal items. The algorithmic approach was faster than non-algorithmic assessment (mean reduction 2.32 min [SD 1.09] per article), classified 100% (n = 2070) of studies, and had good reliability compared to non-algorithmic assessment (ICC 0.77, 95% CI 0.74-0.80). We built the SeroTracker-RoB Excel Tool, which embeds this algorithm for use by other researchers. The SeroTracker-RoB decision-rule based algorithm was faster than non-algorithmic assessment with complete coverage and good reliability. This algorithm enabled rapid, transparent, and reproducible RoB evaluations of seroprevalence studies and may support evidence synthesis efforts during future disease outbreaks. This decision rule-based approach could be applied to other types of prevalence studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,139
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,416
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,861
Score d'incertitude au seuil0,733

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1390,416
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,006
Bibliométrie0,0210,009
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0070,006
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1000,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,443
Tête enseignante GPT0,613
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineReproductibilité
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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