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Enregistrement W4315852265 · doi:10.5376/mpb.2022.13.0030

Development and Purity Identification of InDel Marker Based on Re-resequencing of

2022· article· en· W4315852265 sur OpenAlexvenueno aff
Riyong Wang, Lingling Xie, Huoqiang Zhou, Yifei Wu, Wei Xiao, Zhuqing Zhang, Baobin Mi

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvances in Cucurbitaceae Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIndelGourdBiologyWaxMolecular markerGenomeDNA sequencingGeneticsComputational biologyDNAGeneHorticultureGenotypeSingle-nucleotide polymorphismBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to establish a simple, economic, accurate and reliable method to identify the purity of wax gourd hybrid seeds, an InDel marker characterized by significant differences was developed via whole genome re-sequencing of parent plants of ‘modilong’ wax gourd; Then the developed InDel molecular marker was used to identify the purity of hybrid seeds of ‘modilong’ taking the DNA of its hybrid seeds and parent plants as test DNA, and the obtained results were compared with field identification results. A total of 466 pairs of InDel markers were screened by genome re-resequencing of parent plants of ‘modilong’, and 26 of which with distinct differences were selected to be amplified and both got the strip. Among them, 7 pairs of primers can clearly distinguish the purity of wax gourd samples. The purity of InDel molecular marker identification was more than 99% consistent with the results of field plot planting identification, indicating that the purity results obtained by different methods were highly consistent. The InDel molecular marker screened in this study could be used as the purity identification of wax gourd hybrids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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