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Enregistrement W4315852275 · doi:10.5376/ijh.2022.12.0006

Gene Identification, Evolution and Expression of MDS Family Genes in Mango (<i>Mangifera indica</i>)

2022· article· en· W4315852275 sur OpenAlexvenueno aff
Jiangtao Gai, Peng Wang, Xiuxu Ye, Ruixiong Luo, Yeyuan Chen

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Horticulture · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneGene familyMangiferaBiologyPhylogenetic treeGenomeGeneticsProtein familyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase (MDS) is a key enzyme involved in the 2- C -methyl- D -erythritol-4-phosphate (MEP) pathway. In order to identify the MDS family genes in mango, study the evolution and expression patterns of MDS family genes. In this study, 16 MDS family genes were downloaded from 13 plant genomes by homologous search method and carried out the protein domains, phylogeny and the expression analysis of MDS family genes in mango. The results of protein domain analysis showed that PF02542.16 domain in the protein sequences of mango MDS family genes respectively. The construction of phylogenetic tree found that the MDS family genes in mango evolved after the formation of dicotyledon, and are most closely to the  MDS  gene in  Citrus sinensis . The expression analysis showed that the MDS family genes of mango had the highest expression in the flesh of 'Guifei' at the ripe stage, the second is ' Tainong ', with the lowest expression in 'Jinhuang', and the difference is significant. This research provided a scientific basis for the further analysis of function of mango  MDS  family genes in terpenoid synthesis pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,356

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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