Gene Identification, Evolution and Expression of MDS Family Genes in Mango (<i>Mangifera indica</i>)
Notice bibliographique
Résumé
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase (MDS) is a key enzyme involved in the 2- C -methyl- D -erythritol-4-phosphate (MEP) pathway. In order to identify the MDS family genes in mango, study the evolution and expression patterns of MDS family genes. In this study, 16 MDS family genes were downloaded from 13 plant genomes by homologous search method and carried out the protein domains, phylogeny and the expression analysis of MDS family genes in mango. The results of protein domain analysis showed that PF02542.16 domain in the protein sequences of mango MDS family genes respectively. The construction of phylogenetic tree found that the MDS family genes in mango evolved after the formation of dicotyledon, and are most closely to the MDS gene in Citrus sinensis . The expression analysis showed that the MDS family genes of mango had the highest expression in the flesh of 'Guifei' at the ripe stage, the second is ' Tainong ', with the lowest expression in 'Jinhuang', and the difference is significant. This research provided a scientific basis for the further analysis of function of mango MDS family genes in terpenoid synthesis pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».